More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3461 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  83.25 
 
 		 204 aa  318  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  62.91 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0439  GrpE protein  51.32 
 
 		 171 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00290609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  40.59 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  46.15 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  38.85 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  43.05 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  37.82 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  37.34 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  34.57 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  38.92 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  39.52 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  36.93 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.12 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  39.51 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  37.28 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  41.18 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  35.82 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  38 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  40.37 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  35.64 
 
 		 173 aa  111  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 259 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  36 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  32.51 
 
 		 223 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  39.1 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  42.34 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  36.67 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  38.3 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  47.79 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  33.51 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.21 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  35.44 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  38.75 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  34.95 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  41.54 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  38.19 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.91 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  37.23 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  38.04 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  36.55 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  33.33 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.07 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  34.9 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  33.12 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  33.88 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 198 aa  101  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  33.86 
 
 		 194 aa  101  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.81 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  35.29 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  33.9 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  35.29 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.03 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35.48 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  33.82 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.42 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  38.32 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  36.42 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  40.44 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  35.8 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  29.35 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  28.95 
 
 		 187 aa  99.4  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  37.33 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  35.56 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  35.71 
 
 		 180 aa  98.6  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.81 
 
 		 202 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.36 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  36.79 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.22 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  35.96 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  35.57 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  36.24 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  34.67 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  34.94 
 
 		 228 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  36.36 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>