More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3459 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
370 aa  747    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  94.59 
 
 
370 aa  707    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  74.66 
 
 
373 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  57.75 
 
 
378 aa  421  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  55.2 
 
 
376 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  51.02 
 
 
386 aa  394  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  53.3 
 
 
382 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
382 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  51.83 
 
 
374 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  51.97 
 
 
386 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  48.95 
 
 
380 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 
373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
379 aa  358  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
366 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  47.09 
 
 
388 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  49.47 
 
 
375 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  48.02 
 
 
356 aa  352  4e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  50.85 
 
 
376 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
380 aa  350  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  47.74 
 
 
356 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  49.33 
 
 
377 aa  346  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  48.18 
 
 
381 aa  346  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
379 aa  346  5e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  46.53 
 
 
388 aa  345  8e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  47.46 
 
 
359 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
388 aa  342  4e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  46.25 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  46.51 
 
 
377 aa  339  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
374 aa  338  8e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  45.82 
 
 
377 aa  338  9e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  47.99 
 
 
371 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  49.42 
 
 
377 aa  331  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  47.58 
 
 
375 aa  331  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  47.72 
 
 
371 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  47.72 
 
 
371 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  47.41 
 
 
375 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  47.84 
 
 
368 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
375 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  46.22 
 
 
374 aa  330  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  47.72 
 
 
371 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  47.72 
 
 
371 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2529  chaperone protein DnaJ  45.5 
 
 
379 aa  328  7e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
374 aa  328  9e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  46.92 
 
 
374 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  47.29 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  47.29 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  48.12 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  47.29 
 
 
376 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  47.29 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  47.29 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  47.29 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  47.29 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  46.98 
 
 
384 aa  327  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  48.67 
 
 
375 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
374 aa  325  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  47.01 
 
 
376 aa  326  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  47.01 
 
 
376 aa  325  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
379 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
379 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
379 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
379 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
379 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  48.26 
 
 
375 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  52.84 
 
 
372 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  47.11 
 
 
387 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  47.85 
 
 
374 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  46.24 
 
 
377 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  48.12 
 
 
374 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  43.22 
 
 
388 aa  322  5e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0098  chaperone protein DnaJ  43.7 
 
 
379 aa  322  8e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  47.04 
 
 
374 aa  322  8e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  47.11 
 
 
387 aa  322  8e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  47.85 
 
 
374 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  43.44 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  48.49 
 
 
385 aa  320  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  47.18 
 
 
377 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  44.32 
 
 
377 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  44.59 
 
 
382 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
379 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
379 aa  319  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  45.48 
 
 
379 aa  319  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  50.99 
 
 
373 aa  318  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  47.04 
 
 
377 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  46.19 
 
 
380 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  48.15 
 
 
374 aa  318  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  46.76 
 
 
381 aa  318  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  44.33 
 
 
382 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
374 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
382 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  47.2 
 
 
397 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  47.21 
 
 
373 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  48.81 
 
 
372 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  48.1 
 
 
375 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  47.26 
 
 
373 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  46.19 
 
 
372 aa  316  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  47.03 
 
 
372 aa  316  4e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>