49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3363 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  88.89 
 
 		 234 aa  381  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  57.02 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  34.42 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  32.19 
 
 		 236 aa  98.2  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  31.76 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  29.91 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  31.84 
 
 		 244 aa  94.7  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  31.09 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  31.09 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  34.91 
 
 		 516 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  34.74 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  30.45 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  30.14 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  34.29 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  29.82 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  28.76 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  33.64 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  29.15 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  32.12 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  31.16 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.28 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  30.15 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  23.85 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  24.56 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  30.48 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  26.03 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30 
 
 		 521 aa  65.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  25.23 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3113  hypothetical protein  33.8 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0147985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.92 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  38.04 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  38.61 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  32.43 
 
 		 526 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  28.32 
 
 		 526 aa  48.9  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  28.95 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  37.89 
 
 		 719 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0524  phosphatidate cytidylyltransferase  26.53 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  30.41 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  25.45 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.31 
 
 		 526 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  29.82 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05650  dolichol kinase, putative  27.32 
 
 		 1011 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  33.67 
 
 		 387 aa  42.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>