More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3332 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
370 aa  748    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  81.89 
 
 
370 aa  611  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  52.3 
 
 
371 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  54.03 
 
 
366 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  40.99 
 
 
382 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  39.9 
 
 
400 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  42.5 
 
 
381 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  39.64 
 
 
408 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  41.09 
 
 
385 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  46.1 
 
 
386 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  36.72 
 
 
371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
374 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  38.76 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  38.75 
 
 
373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
393 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  39.83 
 
 
384 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 
395 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
417 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  35.46 
 
 
336 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
420 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  36.66 
 
 
375 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  45.59 
 
 
431 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
374 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
364 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  40.83 
 
 
382 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
366 aa  192  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
361 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
394 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 
435 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  36.72 
 
 
355 aa  189  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  38.28 
 
 
353 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
361 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  33.6 
 
 
364 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 
535 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  35 
 
 
381 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  36.26 
 
 
351 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  40.38 
 
 
380 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
380 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
372 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  41.27 
 
 
373 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
360 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
366 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  40.56 
 
 
381 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
370 aa  179  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  35.23 
 
 
372 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
376 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
369 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  35.23 
 
 
372 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
378 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
346 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  36.81 
 
 
346 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  39.58 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  40.45 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  39.8 
 
 
524 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
378 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 
371 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
381 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  33.44 
 
 
430 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  31.12 
 
 
381 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
382 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  30.59 
 
 
381 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  32.62 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  29.18 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.18 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.18 
 
 
361 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  35.18 
 
 
361 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
384 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.18 
 
 
414 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.18 
 
 
414 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.18 
 
 
414 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.18 
 
 
401 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  40.66 
 
 
423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  38.03 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  28.91 
 
 
375 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  35.97 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  39.41 
 
 
380 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
360 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
444 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.55 
 
 
364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
398 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
428 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
383 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 
343 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
398 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
366 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
366 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>