More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3326 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
141 aa  280  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  93.62 
 
 
141 aa  266  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  78.01 
 
 
141 aa  229  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  77.3 
 
 
141 aa  219  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
140 aa  202  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
140 aa  201  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  66.19 
 
 
143 aa  199  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  66.19 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 
141 aa  197  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  67.14 
 
 
140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  63.83 
 
 
142 aa  196  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  65.96 
 
 
141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 
142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
141 aa  194  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 
143 aa  194  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 
142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  63.12 
 
 
141 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 
141 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 
141 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
142 aa  191  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  64.54 
 
 
141 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  63.12 
 
 
141 aa  190  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
141 aa  190  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  190  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  189  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  189  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  63.5 
 
 
141 aa  187  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  64.23 
 
 
143 aa  187  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  62.41 
 
 
141 aa  187  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
143 aa  187  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 
141 aa  187  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
143 aa  187  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  61.87 
 
 
143 aa  186  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 
140 aa  186  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
143 aa  186  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  61.15 
 
 
143 aa  186  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 
140 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 
140 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 
142 aa  185  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 
144 aa  185  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 
141 aa  185  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 
141 aa  184  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  184  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  62.77 
 
 
140 aa  183  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 
143 aa  183  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  60.58 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  62.77 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  61.15 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  61.31 
 
 
143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  62.04 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  62.59 
 
 
144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  61.31 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  63.5 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 
144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  67.44 
 
 
144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
142 aa  179  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  61.15 
 
 
141 aa  179  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  62.04 
 
 
143 aa  179  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  61.87 
 
 
144 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 
143 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  62.22 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 
142 aa  177  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  61.31 
 
 
144 aa  177  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 
141 aa  177  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 
141 aa  177  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 
144 aa  177  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 
141 aa  176  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  61.31 
 
 
143 aa  176  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 
141 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 
141 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  62.04 
 
 
144 aa  175  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  60 
 
 
142 aa  174  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 
141 aa  174  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 
141 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 
141 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 
141 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>