More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3242 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
227 aa  471  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  98.24 
 
 
227 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  80.36 
 
 
230 aa  380  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  79.91 
 
 
230 aa  378  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  68 
 
 
230 aa  333  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  53.04 
 
 
227 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  53.28 
 
 
229 aa  225  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  48.29 
 
 
249 aa  221  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  51.1 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  47.79 
 
 
393 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  51.53 
 
 
238 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  47.44 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  48.91 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  46.81 
 
 
280 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  45.06 
 
 
238 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  48.68 
 
 
227 aa  205  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  44.64 
 
 
240 aa  205  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 
244 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  46.02 
 
 
235 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  46.02 
 
 
235 aa  201  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  45.69 
 
 
234 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  43.61 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 
519 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
234 aa  184  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 
531 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 
527 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  40.45 
 
 
271 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  40.45 
 
 
271 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  38.67 
 
 
527 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
685 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 
514 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 
314 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
394 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
340 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
298 aa  106  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
305 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1270  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
514 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
336 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 
410 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
293 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
411 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
319 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
304 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
340 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 
228 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
303 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
272 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
253 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
235 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  34.76 
 
 
410 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
253 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
378 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.33 
 
 
410 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  29.83 
 
 
250 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  33 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.57 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
308 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
389 aa  96.7  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
311 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
586 aa  95.5  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
285 aa  95.1  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
256 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.71 
 
 
382 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
324 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
340 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
318 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
266 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
311 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
295 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
321 aa  92.8  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
278 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
336 aa  92  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
472 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
230 aa  92  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
229 aa  92  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
324 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
314 aa  91.7  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
347 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3836  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
448 aa  90.5  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5177  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
320 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
353 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>