60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3233 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  70.93 
 
 		 540 aa  746    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  61.31 
 
 		 565 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  91.08 
 
 		 538 aa  955    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  100 
 
 		 538 aa  1073    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  57.3 
 
 		 551 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  56.58 
 
 		 509 aa  565  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  57.04 
 
 		 537 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  57.14 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  54.78 
 
 		 515 aa  558  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  57.01 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  50.86 
 
 		 602 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  50.86 
 
 		 602 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  50.09 
 
 		 605 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  50.87 
 
 		 588 aa  527  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  50.87 
 
 		 579 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  49.4 
 
 		 579 aa  517  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  47.47 
 
 		 590 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  50.09 
 
 		 584 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  51.63 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  49.91 
 
 		 545 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  48.84 
 
 		 539 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  50.37 
 
 		 496 aa  455  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  49.81 
 
 		 546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  43.04 
 
 		 552 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  59.46 
 
 		 335 aa  391  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  39.81 
 
 		 322 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  39.68 
 
 		 318 aa  212  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  37.23 
 
 		 386 aa  190  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  34.59 
 
 		 322 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  27.97 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  33.7 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  26.64 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  27.21 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  26.64 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  26.97 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  26.97 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  26.64 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  26.84 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  26.84 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  26.84 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  26.84 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  25.66 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  26.49 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  25.74 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  30.21 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  28.49 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  28.57 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  33.16 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  27.75 
 
 		 308 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  27.76 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  29.45 
 
 		 331 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  29.79 
 
 		 313 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  25.74 
 
 		 313 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  28.93 
 
 		 332 aa  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  27.85 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  28.06 
 
 		 345 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  29.25 
 
 		 322 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  28.46 
 
 		 342 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1793  stage III sporulation protein AA  29.72 
 
 		 334 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0956  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 342 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.241792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>