More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3232 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  100 
 
 
226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  90.31 
 
 
229 aa  400  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  69.37 
 
 
225 aa  304  7e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  60.85 
 
 
236 aa  279  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  191  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  47.14 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  48.84 
 
 
205 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.06 
 
 
206 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.81 
 
 
219 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.27 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  48.06 
 
 
210 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.54 
 
 
217 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  44.29 
 
 
214 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  49.51 
 
 
202 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  43.95 
 
 
224 aa  167  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  42.79 
 
 
207 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.79 
 
 
207 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  42.13 
 
 
208 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  43.38 
 
 
215 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.94 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  37.56 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  41.98 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.59 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.44 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  41.82 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  41.82 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.86 
 
 
221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.26 
 
 
217 aa  161  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  39.81 
 
 
203 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.33 
 
 
213 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.75 
 
 
223 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  41.2 
 
 
211 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.67 
 
 
211 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  43.69 
 
 
207 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  40.95 
 
 
217 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  42.25 
 
 
222 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40.28 
 
 
209 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  41.26 
 
 
219 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.47 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  45.71 
 
 
225 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  39.72 
 
 
208 aa  154  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  48.13 
 
 
217 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  41.75 
 
 
671 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.86 
 
 
214 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  39.64 
 
 
219 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.76 
 
 
210 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.5 
 
 
688 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  40.19 
 
 
234 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  40.38 
 
 
219 aa  152  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.39 
 
 
686 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.51 
 
 
214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  43.3 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.66 
 
 
686 aa  151  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  42.38 
 
 
210 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.24 
 
 
213 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  40.58 
 
 
218 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  39.21 
 
 
234 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  41.06 
 
 
705 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  38.42 
 
 
211 aa  149  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  43.52 
 
 
707 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  40.87 
 
 
211 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  40.82 
 
 
225 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.43 
 
 
212 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  43.52 
 
 
217 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  43.66 
 
 
197 aa  148  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  39.81 
 
 
901 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.13 
 
 
197 aa  148  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  40 
 
 
236 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  38.74 
 
 
233 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  40.93 
 
 
230 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  38.68 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  44.44 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  41.83 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.23 
 
 
232 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  41.75 
 
 
688 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  46.43 
 
 
225 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  36.67 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  36.74 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  36.74 
 
 
223 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  39.07 
 
 
214 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  40.72 
 
 
226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  40.87 
 
 
703 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  38.6 
 
 
211 aa  144  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  40.38 
 
 
244 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  43.4 
 
 
220 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  40.93 
 
 
221 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  43.43 
 
 
222 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  43.72 
 
 
217 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  43.72 
 
 
217 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  40.27 
 
 
213 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.35 
 
 
216 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  38.32 
 
 
208 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  38.32 
 
 
208 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  37.56 
 
 
212 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  38.32 
 
 
208 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  39.19 
 
 
210 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  41.12 
 
 
209 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  43 
 
 
213 aa  141  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  40.28 
 
 
226 aa  141  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  38.1 
 
 
210 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>