More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3212 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 388 aa  800    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  85.64 
 
 		 388 aa  684    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  64.29 
 
 		 225 aa  301  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.81 
 
 		 230 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.46 
 
 		 248 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.46 
 
 		 248 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 		 237 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  48.03 
 
 		 233 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.65 
 
 		 226 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 		 224 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.22 
 
 		 232 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.49 
 
 		 239 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 226 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.4 
 
 		 230 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.75 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  47.79 
 
 		 233 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.26 
 
 		 252 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 226 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 220 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 238 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  48.93 
 
 		 253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  45.58 
 
 		 242 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  47.23 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 		 224 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 		 224 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 246 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 224 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 224 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 224 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 224 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 		 224 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.99 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  43.85 
 
 		 252 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.35 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  46.75 
 
 		 234 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  43.59 
 
 		 239 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  45.18 
 
 		 234 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  44 
 
 		 259 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 		 224 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.95 
 
 		 229 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  43.95 
 
 		 224 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  46.67 
 
 		 225 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.75 
 
 		 235 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.05 
 
 		 235 aa  209  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.29 
 
 		 256 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.19 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.75 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.34 
 
 		 240 aa  208  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 228 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  48.44 
 
 		 228 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  43.61 
 
 		 239 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 236 aa  207  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 240 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  43.85 
 
 		 254 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  44.73 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45.95 
 
 		 226 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  48.51 
 
 		 227 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  45.05 
 
 		 248 aa  206  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.84 
 
 		 234 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 240 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  46.02 
 
 		 227 aa  206  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 		 286 aa  206  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  46.64 
 
 		 245 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  41.91 
 
 		 241 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  44.14 
 
 		 235 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 232 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 		 227 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  48.64 
 
 		 249 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.24 
 
 		 237 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.55 
 
 		 226 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.21 
 
 		 236 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 227 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  45.09 
 
 		 237 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 231 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  46.46 
 
 		 235 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.49 
 
 		 234 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.49 
 
 		 234 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 222 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  47.39 
 
 		 228 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  47.73 
 
 		 244 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  44.14 
 
 		 235 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  46.49 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.98 
 
 		 236 aa  202  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  45.74 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.11 
 
 		 239 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>