More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3154 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  88.79 
 
 		 665 aa  1200    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  64.02 
 
 		 653 aa  843    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  54.55 
 
 		 641 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 669 aa  1366    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  42.59 
 
 		 607 aa  530  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  43.68 
 
 		 624 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  41.23 
 
 		 625 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  41.31 
 
 		 607 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  41.31 
 
 		 607 aa  498  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40.85 
 
 		 607 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  41.19 
 
 		 613 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  42.54 
 
 		 588 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  43.54 
 
 		 614 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 		 620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.23 
 
 		 620 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  41.37 
 
 		 613 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  40.37 
 
 		 615 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.12 
 
 		 611 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 628 aa  458  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.87 
 
 		 685 aa  458  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  44.03 
 
 		 622 aa  451  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  41.69 
 
 		 613 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  38.19 
 
 		 649 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  39.76 
 
 		 666 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  39.27 
 
 		 614 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  38.02 
 
 		 658 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 		 594 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 		 594 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 594 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 594 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 594 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.65 
 
 		 604 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  38.53 
 
 		 678 aa  432  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 594 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 596 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  36.03 
 
 		 671 aa  426  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 594 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  37.08 
 
 		 601 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 		 617 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.05 
 
 		 656 aa  422  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 		 708 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  38.43 
 
 		 591 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 		 649 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  38.13 
 
 		 675 aa  418  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  39.46 
 
 		 604 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 623 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 610 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  38.95 
 
 		 613 aa  416  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.85 
 
 		 607 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 646 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 678 aa  416  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.68 
 
 		 613 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 		 591 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  37.95 
 
 		 665 aa  415  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  38.69 
 
 		 617 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 		 631 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.2 
 
 		 638 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 676 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  36.61 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  37.48 
 
 		 660 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  36.07 
 
 		 644 aa  412  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  39.82 
 
 		 609 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 636 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  37.91 
 
 		 693 aa  412  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  36.24 
 
 		 612 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 676 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  36.2 
 
 		 647 aa  412  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  37.13 
 
 		 675 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 676 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 		 692 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 		 679 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.02 
 
 		 593 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  38.79 
 
 		 590 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  37.63 
 
 		 619 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  37.59 
 
 		 649 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  39.64 
 
 		 644 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  36.31 
 
 		 593 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  38.56 
 
 		 623 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  36.31 
 
 		 593 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  35.73 
 
 		 616 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  34.96 
 
 		 598 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  37.59 
 
 		 626 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 623 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 		 623 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 		 627 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  38.34 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  36.2 
 
 		 669 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  38.19 
 
 		 641 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  35.61 
 
 		 670 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  36.58 
 
 		 690 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 624 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 		 627 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  35.68 
 
 		 674 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 		 705 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 604 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  37.22 
 
 		 707 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>