More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3145 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 535 aa  1061    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 		 264 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 268 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 314 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 		 268 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 		 271 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.56 
 
 		 257 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 276 aa  100  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 		 271 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 		 264 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  35.95 
 
 		 275 aa  98.6  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 		 255 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 278 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 260 aa  96.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0649  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 261 aa  96.7  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 		 262 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.6 
 
 		 270 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 		 256 aa  95.9  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 270 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 321 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 262 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.33 
 
 		 263 aa  94.4  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 272 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 268 aa  94  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 241 aa  94  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 		 238 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 262 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 269 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 		 268 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 248 aa  92.8  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.52 
 
 		 258 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 264 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 285 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 344 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 262 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 285 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 285 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 272 aa  90.9  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 218 aa  90.5  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.42 
 
 		 257 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1192  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.41 
 
 		 255 aa  90.9  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  29.3 
 
 		 516 aa  90.1  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 273 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 		 257 aa  90.1  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003615  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  26.69 
 
 		 264 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 258 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 282 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 262 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 262 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 269 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 590 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.77 
 
 		 266 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 		 266 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 262 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 273 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 266 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 246 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.664099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 263 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 259 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  28.85 
 
 		 259 aa  87.4  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 253 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 		 268 aa  87.4  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00216  conserved hypothetical protein  35.47 
 
 		 359 aa  87  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110281  normal  0.352442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 592 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 		 255 aa  87  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 		 247 aa  87  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 269 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 251 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 225 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 248 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 269 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.685444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85576  1-acyl dihydroxyacetone phosphate reductase  34.2 
 
 		 297 aa  86.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.764393  hitchhiker  0.00283469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2407  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 278 aa  86.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 268 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.79 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  30.39 
 
 		 257 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.43 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 254 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  30.39 
 
 		 257 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  32.55 
 
 		 254 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.33 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  29.89 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  31 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.43 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>