54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3119 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  83.67 
 
 		 298 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  55.51 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  47.65 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  35.1 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  42.19 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  39.33 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  36.49 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  37.84 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  38.41 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  33.76 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  37.04 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  31.3 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  29.6 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  29.94 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  31.9 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  31.51 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.33 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  28.09 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  35.58 
 
 		 208 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  26.09 
 
 		 197 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  40.82 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  33.01 
 
 		 412 aa  53.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  25.76 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  33 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  29.52 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  28.3 
 
 		 384 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  32.09 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  29.03 
 
 		 323 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  30.37 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.33 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  30 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  31.52 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  30.33 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  31.73 
 
 		 192 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  33.66 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  30.58 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.71 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  28.12 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  28.03 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  31.18 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  27.41 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  30.67 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  29 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  29.63 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.08 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  28.57 
 
 		 223 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  31.31 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  29.41 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  35.92 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  32.08 
 
 		 204 aa  42.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  31.71 
 
 		 214 aa  42.7  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  26.45 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.63 
 
 		 228 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>