More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3113 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  87.25 
 
 		 410 aa  733    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 415 aa  847    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  62.53 
 
 		 457 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  71.57 
 
 		 410 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  65.2 
 
 		 418 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  57.87 
 
 		 451 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  54.68 
 
 		 419 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  54.41 
 
 		 414 aa  448  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  46.1 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  46.8 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  45.36 
 
 		 387 aa  363  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  45.91 
 
 		 409 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  50.85 
 
 		 421 aa  342  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  42.72 
 
 		 412 aa  329  7e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  45.37 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  45.39 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  44.44 
 
 		 403 aa  292  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  41.81 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  46.26 
 
 		 414 aa  286  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  42.93 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  42.07 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  41.38 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  41.52 
 
 		 400 aa  264  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  35.61 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  37.09 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  37.8 
 
 		 397 aa  233  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  36.45 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  32.93 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  34.67 
 
 		 604 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  34.67 
 
 		 604 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  35.56 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.83 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.18 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.13 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  33.64 
 
 		 626 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.43 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.88 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.94 
 
 		 673 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.52 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  32.27 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  32.86 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.94 
 
 		 664 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.86 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.88 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.65 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.54 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.71 
 
 		 674 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.71 
 
 		 672 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.88 
 
 		 429 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  32.54 
 
 		 420 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  32.3 
 
 		 423 aa  206  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.88 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.46 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.41 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.76 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.12 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.3 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.63 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.15 
 
 		 644 aa  203  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.18 
 
 		 657 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.68 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  32.86 
 
 		 412 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.79 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.38 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.26 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  33.5 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.01 
 
 		 420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  31.39 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  35.68 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.63 
 
 		 678 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.26 
 
 		 662 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  29.6 
 
 		 665 aa  200  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.41 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 		 419 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.31 
 
 		 408 aa  199  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  32.62 
 
 		 419 aa  199  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.72 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.01 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.01 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.51 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  30.79 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  32.24 
 
 		 688 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  35.92 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.49 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.39 
 
 		 621 aa  196  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.87 
 
 		 433 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  33.26 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.82 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.85 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  29.98 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.63 
 
 		 419 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.24 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  31.04 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.62 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  32.01 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.91 
 
 		 610 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.8 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  29.36 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.73 
 
 		 412 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  30.31 
 
 		 420 aa  192  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>