More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3094 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
324 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  89.81 
 
 
315 aa  574  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  77.12 
 
 
311 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  51.89 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  46.18 
 
 
287 aa  255  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.52 
 
 
334 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.25 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  47 
 
 
289 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  39.54 
 
 
301 aa  228  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  40.84 
 
 
324 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  39.67 
 
 
307 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  40.54 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  38.79 
 
 
339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  42.77 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  42.22 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  39.42 
 
 
330 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  40.61 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.47 
 
 
330 aa  210  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.12 
 
 
317 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  39.94 
 
 
314 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.18 
 
 
316 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  40.12 
 
 
313 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  40.12 
 
 
341 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  39.82 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  40.06 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.5 
 
 
325 aa  200  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  41.58 
 
 
306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  41.58 
 
 
306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  41.58 
 
 
306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  41.58 
 
 
306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  41.91 
 
 
306 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  41.58 
 
 
306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  41.91 
 
 
306 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.52 
 
 
317 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  41.58 
 
 
306 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  41.58 
 
 
306 aa  198  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  41.58 
 
 
306 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  41.58 
 
 
306 aa  198  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  41.58 
 
 
306 aa  198  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  41.58 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  36.42 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  41.14 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  38.06 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  42.42 
 
 
294 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  41.25 
 
 
306 aa  196  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  38.71 
 
 
291 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.1 
 
 
324 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  38.51 
 
 
340 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40.06 
 
 
302 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  38.85 
 
 
295 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 
323 aa  192  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  38.71 
 
 
309 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  40.94 
 
 
325 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  40.45 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  37.42 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.83 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  33.63 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.42 
 
 
319 aa  188  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  40.55 
 
 
315 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.72 
 
 
320 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  36.16 
 
 
375 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  34.77 
 
 
381 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  39.88 
 
 
314 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  38.17 
 
 
335 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  38.17 
 
 
335 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.1 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.97 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.66 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  41.78 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  38.24 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  38.84 
 
 
313 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  41.48 
 
 
314 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  41.45 
 
 
318 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  41.45 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.09 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.93 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  37.75 
 
 
326 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  39.81 
 
 
319 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  40.49 
 
 
318 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  37.42 
 
 
314 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  38.26 
 
 
340 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  36.2 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  34.8 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.5 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  37.59 
 
 
301 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  35.03 
 
 
330 aa  179  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  38.85 
 
 
316 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  38.85 
 
 
304 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.12 
 
 
392 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  35.5 
 
 
297 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  38.04 
 
 
315 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  36.86 
 
 
303 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  35.56 
 
 
374 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  36.67 
 
 
299 aa  177  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1601  chaperone protein DnaJ  33.52 
 
 
376 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.095683  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  35.98 
 
 
370 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.87 
 
 
318 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  40 
 
 
316 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  34.44 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  37.04 
 
 
318 aa  172  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>