More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3039 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 445 aa  899    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  91.1 
 
 		 445 aa  811    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  51.17 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  48.17 
 
 		 472 aa  352  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  39.95 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  42.33 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 		 379 aa  216  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  36.12 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  37.28 
 
 		 400 aa  201  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 		 377 aa  200  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  38.37 
 
 		 423 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  38.11 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  36.47 
 
 		 478 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  35.43 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 		 456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  35.28 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  37.67 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.18 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 478 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 469 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 469 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.57 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 478 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  34.9 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.19 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  36.99 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  33.84 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  36.42 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 		 478 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  35.05 
 
 		 428 aa  193  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  34.67 
 
 		 479 aa  193  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  37.54 
 
 		 441 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  34.61 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.44 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  35.01 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  35.17 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  34.35 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 		 444 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.81 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  34.74 
 
 		 444 aa  190  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  37.97 
 
 		 439 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  34.42 
 
 		 482 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  35.38 
 
 		 515 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 480 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  36.36 
 
 		 521 aa  189  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  36.08 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  36.08 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  36.08 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  36.08 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  35.1 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 		 455 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  35.1 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  36.08 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  36.12 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  35.1 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  36.42 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  33.59 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  37.96 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  32.66 
 
 		 478 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  32.46 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  34.56 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  34.12 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  36.13 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  35.38 
 
 		 515 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 		 476 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 		 498 aa  187  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  33.01 
 
 		 477 aa  186  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.2 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  34.3 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  36.2 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  34.75 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  36.2 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  34.46 
 
 		 401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  32.07 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.58 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  36.61 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  34.82 
 
 		 511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  35.82 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  35.1 
 
 		 513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  32.77 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>