171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3012 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 332 aa  669    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  85.54 
 
 		 332 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.16 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  37.24 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.69 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.34 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  32.84 
 
 		 545 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.43 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  34.01 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  35.76 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  31.82 
 
 		 598 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.15 
 
 		 553 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.82 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.03 
 
 		 544 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.9 
 
 		 731 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.7 
 
 		 550 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  30.55 
 
 		 731 aa  159  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  35.61 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.63 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  33.43 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  33.73 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  33.03 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  32.49 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  32.84 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  35.8 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.29 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  34.21 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  29.24 
 
 		 727 aa  153  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  33.13 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  32.66 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.56 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.97 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.3 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  31.59 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  31.87 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.23 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.27 
 
 		 570 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  35.26 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  32.85 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  32.46 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  33.03 
 
 		 594 aa  146  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  34.8 
 
 		 525 aa  146  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  29.36 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.9 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  32.95 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.04 
 
 		 580 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  29.82 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.94 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.41 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  30.43 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.24 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.07 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  35.54 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  31.67 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.28 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  32.65 
 
 		 344 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  31.5 
 
 		 343 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.75 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.56 
 
 		 559 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.09 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.34 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.07 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  29.82 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.84 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.95 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.22 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  30.51 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  33.12 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.95 
 
 		 342 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.04 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.51 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  29.03 
 
 		 342 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  33.63 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  30.7 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  32.56 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  32.28 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  32.32 
 
 		 558 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.06 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.38 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  28.95 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  26.77 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.32 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.81 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 691 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  26.48 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.35 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  27.16 
 
 		 384 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  27.89 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  25.7 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.3 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.49 
 
 		 343 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.85 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  26.28 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  25.98 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  24.61 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  28.68 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  26.28 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  25.22 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  31.63 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>