82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3010 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  82.42 
 
 
91 aa  160  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.19 
 
 
92 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.98 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  37.36 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  40.66 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.46 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  44.3 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  35.16 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.94 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  44.3 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.77 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  39.08 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.05 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.37 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  44.44 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  39.24 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  42.68 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.82 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  37.8 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  35.87 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  37.8 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  37.35 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  37.8 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  36.47 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  37.35 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.21 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.38 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
91 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  34.12 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  34.38 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  37.35 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  34.94 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  34.88 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  32.53 
 
 
96 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  43.24 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  36.9 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  35.16 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.06 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.35 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.94 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.21 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  37.18 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.58 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.76 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  33.73 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  31.87 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.68 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 
96 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 
87 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  39.66 
 
 
98 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  28.57 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  59.46 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  39.44 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  29.67 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  29.67 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  30.12 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  27.96 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.77 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  28.24 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.8 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1149  CRISPR-associated Cas2 family protein  35 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399869  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.14 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  37.25 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  28.41 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.91 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.12 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  31.4 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2292  CRISPR-associated protein Cas2  34.33 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1801  CRISPR-associated protein Cas2  59.38 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.23 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  30.12 
 
 
96 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>