More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2990 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 268 aa  557  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  94.03 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  78.16 
 
 		 264 aa  424  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  69.81 
 
 		 250 aa  324  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.45 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.59 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.59 
 
 		 200 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.14 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.64 
 
 		 200 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 		 179 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  57.99 
 
 		 179 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 		 170 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  55.75 
 
 		 184 aa  209  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  56.71 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 213 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  59.48 
 
 		 173 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 166 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  59.48 
 
 		 178 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.91 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  56.88 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  55.49 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 		 190 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 		 170 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.06 
 
 		 202 aa  201  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  60.65 
 
 		 189 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  56.97 
 
 		 190 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  56.97 
 
 		 190 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.27 
 
 		 170 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 		 182 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  64.08 
 
 		 173 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.59 
 
 		 170 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  59.35 
 
 		 189 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  57.72 
 
 		 172 aa  198  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 		 183 aa  198  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 		 189 aa  198  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.38 
 
 		 196 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  53.59 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1594  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.9 
 
 		 187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.15 
 
 		 169 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.01 
 
 		 183 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  56.38 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.58 
 
 		 167 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 172 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 172 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 172 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 172 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.76 
 
 		 170 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 172 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 172 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.11 
 
 		 183 aa  195  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.93 
 
 		 191 aa  195  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  50.82 
 
 		 199 aa  195  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  59.59 
 
 		 188 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.12 
 
 		 180 aa  194  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  54.22 
 
 		 174 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  64.54 
 
 		 170 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  61.7 
 
 		 170 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 		 182 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.7 
 
 		 183 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.33 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 159 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  58.04 
 
 		 793 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  51.81 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 		 189 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.43 
 
 		 188 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  59.87 
 
 		 170 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.43 
 
 		 188 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 226 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 159 aa  191  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 159 aa  191  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.36 
 
 		 792 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.96 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.55 
 
 		 183 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  62.86 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  51.72 
 
 		 184 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 		 159 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 		 159 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  57.82 
 
 		 158 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  57.82 
 
 		 158 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  57.75 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 		 169 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 		 167 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  51.72 
 
 		 184 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>