More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2979 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  475  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  94.51 
 
 
237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  73.39 
 
 
259 aa  360  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  73.84 
 
 
238 aa  353  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  73.5 
 
 
235 aa  344  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  67.23 
 
 
237 aa  316  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  68.24 
 
 
235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  66.67 
 
 
235 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  65.67 
 
 
235 aa  309  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.81 
 
 
234 aa  308  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  63.52 
 
 
235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  64.26 
 
 
256 aa  301  9e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  60.59 
 
 
236 aa  299  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  61.37 
 
 
234 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  61.97 
 
 
239 aa  298  6e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  61.97 
 
 
239 aa  297  9e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  63.09 
 
 
239 aa  297  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  62.23 
 
 
235 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  59.66 
 
 
238 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  60.52 
 
 
236 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  60.09 
 
 
234 aa  291  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  61.8 
 
 
234 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.8 
 
 
234 aa  289  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  62.82 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  61.54 
 
 
234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  64.85 
 
 
237 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  58.3 
 
 
236 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  55.98 
 
 
234 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  61.97 
 
 
234 aa  279  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  61.37 
 
 
238 aa  279  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  60.09 
 
 
233 aa  279  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  62.82 
 
 
234 aa  278  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  62.39 
 
 
234 aa  278  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  56.78 
 
 
237 aa  278  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  61.37 
 
 
235 aa  278  6e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  61.97 
 
 
236 aa  278  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  61.7 
 
 
256 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  61.54 
 
 
236 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  59.66 
 
 
242 aa  277  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  57.94 
 
 
238 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  58.55 
 
 
237 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  59.07 
 
 
241 aa  274  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  57.51 
 
 
233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  57.74 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  60.52 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  56.22 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  56.22 
 
 
235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  55.32 
 
 
236 aa  272  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  58.23 
 
 
241 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  58.23 
 
 
241 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 
235 aa  271  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  55.32 
 
 
237 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  57.14 
 
 
239 aa  271  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  57.51 
 
 
233 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  57.02 
 
 
238 aa  269  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  58.55 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  56.17 
 
 
236 aa  268  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  57.69 
 
 
235 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
237 aa  267  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  58.05 
 
 
247 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  55.36 
 
 
234 aa  266  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  56.12 
 
 
239 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  58.05 
 
 
247 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  58.8 
 
 
258 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  57.63 
 
 
247 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  56.72 
 
 
247 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  57.94 
 
 
234 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  56.17 
 
 
237 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  54.89 
 
 
237 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 
233 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.89 
 
 
236 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 
234 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
238 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  57.26 
 
 
265 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  55.56 
 
 
244 aa  262  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  56.22 
 
 
238 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  53.65 
 
 
234 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  56.17 
 
 
236 aa  262  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  55.56 
 
 
238 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 
238 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  55.04 
 
 
247 aa  262  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
233 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  56.65 
 
 
244 aa  261  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  56.22 
 
 
233 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  57.63 
 
 
253 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  56.22 
 
 
233 aa  261  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.98 
 
 
248 aa  260  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  56.22 
 
 
244 aa  260  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  55.08 
 
 
238 aa  259  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  56.22 
 
 
233 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  58.67 
 
 
251 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  56.65 
 
 
233 aa  259  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
247 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 
235 aa  259  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  55.08 
 
 
236 aa  259  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  55.98 
 
 
234 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 
247 aa  258  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 
235 aa  258  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  56.84 
 
 
237 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  56.84 
 
 
237 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>