More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2967 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  93.5 
 
 
431 aa  842  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  9.05056e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
431 aa  888  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  42.28 
 
 
418 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  44.68 
 
 
443 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  43.66 
 
 
436 aa  316  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  36.6 
 
 
442 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  36.3 
 
 
432 aa  300  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  36.97 
 
 
417 aa  275  1e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  32.71 
 
 
439 aa  240  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 
399 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  32.59 
 
 
446 aa  229  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 
413 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 
443 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  34.04 
 
 
447 aa  223  5e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  31.4 
 
 
446 aa  223  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  31.4 
 
 
446 aa  221  2e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  34.35 
 
 
455 aa  220  4e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  34.68 
 
 
439 aa  219  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  28.81 
 
 
427 aa  215  1e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  33.82 
 
 
407 aa  213  4e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  32.98 
 
 
472 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  33.12 
 
 
458 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 
437 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  33.18 
 
 
419 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  34.01 
 
 
450 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 
411 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  32.8 
 
 
439 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  29.47 
 
 
438 aa  206  9e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  31.79 
 
 
478 aa  206  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  34.96 
 
 
388 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  32.14 
 
 
476 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  33.82 
 
 
401 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
427 aa  202  1e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  30.54 
 
 
451 aa  201  2e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  31.67 
 
 
478 aa  197  4e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  28.79 
 
 
465 aa  197  4e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 
489 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  32.1 
 
 
444 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
467 aa  193  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  3.40299e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  27.74 
 
 
446 aa  192  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  32.24 
 
 
456 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  30.67 
 
 
463 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  29.95 
 
 
447 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  31.34 
 
 
470 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  28.51 
 
 
452 aa  191  3e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 
517 aa  190  3e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  31.58 
 
 
463 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  32.66 
 
 
465 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  33.18 
 
 
458 aa  189  6e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  29.96 
 
 
474 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  30.97 
 
 
472 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  34.46 
 
 
436 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  31.5 
 
 
452 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  30.43 
 
 
447 aa  186  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  29.74 
 
 
453 aa  185  1e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  30.88 
 
 
440 aa  185  1e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  30.16 
 
 
448 aa  185  1e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  33.18 
 
 
447 aa  184  2e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  31.45 
 
 
478 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  28.13 
 
 
471 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  32.88 
 
 
437 aa  183  4e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  28.72 
 
 
475 aa  183  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  30.19 
 
 
484 aa  182  8e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  30.32 
 
 
457 aa  182  9e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  31.81 
 
 
460 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  29.78 
 
 
452 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  31.21 
 
 
448 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  30.09 
 
 
457 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  29.09 
 
 
479 aa  181  3e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.56 
 
 
449 aa  181  3e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  31.01 
 
 
456 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  28.67 
 
 
450 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  31.58 
 
 
482 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  30.52 
 
 
454 aa  180  5e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  29.02 
 
 
494 aa  180  5e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  31.79 
 
 
457 aa  180  5e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  31.78 
 
 
494 aa  179  6e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  30.56 
 
 
474 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  28.79 
 
 
450 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  30.64 
 
 
485 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  29.71 
 
 
482 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  32.05 
 
 
445 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 
486 aa  176  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  7.39457e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  33.86 
 
 
443 aa  176  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  29.57 
 
 
444 aa  176  1e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  30.62 
 
 
487 aa  174  2e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  28.22 
 
 
446 aa  174  4e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  31.41 
 
 
479 aa  172  7e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  30.27 
 
 
453 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  29.09 
 
 
462 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  26.61 
 
 
484 aa  170  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.15907e-05  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  30.27 
 
 
488 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  33.79 
 
 
472 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  28.72 
 
 
467 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 
473 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  29.02 
 
 
452 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  28.87 
 
 
499 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  26.68 
 
 
468 aa  167  3e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.64556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
513 aa  167  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  31.78 
 
 
448 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>