More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2958 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
404 aa  795    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  80.4 
 
 
410 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  59.06 
 
 
414 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  49.88 
 
 
409 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
414 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.11 
 
 
401 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
378 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
382 aa  143  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
426 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 
426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  34.57 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
904 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
452 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
415 aa  126  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  26.85 
 
 
403 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
415 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
386 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
396 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
383 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
382 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
386 aa  124  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
394 aa  122  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
376 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
359 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
410 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2841  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
420 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 
381 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
390 aa  119  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
411 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2472  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  34.2 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  28.3 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  35.13 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
394 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
410 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
384 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
417 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
401 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
391 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
355 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
355 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
379 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 
370 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  43.1 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
405 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
355 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
394 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.39 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  34.59 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  21.82 
 
 
391 aa  111  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
374 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
424 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  35.69 
 
 
375 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
377 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
417 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
438 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 
365 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
413 aa  110  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
438 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>