87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2954 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 133 aa  264  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  37.17 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  34.86 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  35.45 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  36.27 
 
 		 292 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  35.92 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  32.73 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  32.81 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  33.03 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  35.45 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  26.36 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  29.09 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  31.45 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  33.9 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  32.08 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  37.61 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  33.59 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  34.82 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  30.84 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  31.19 
 
 		 271 aa  53.9  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  32.35 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  28.46 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  35.19 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  35.34 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  31.62 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  43.86 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  43.86 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  31.03 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  33.62 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  32.73 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 241 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  28.28 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  28.28 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  30.93 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  42.47 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  24.79 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  38.98 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0545  DNA polymerase beta subunit  28.18 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  30.28 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  30.7 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  30.47 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  41.07 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  33.82 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  33.82 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  43.14 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  40.35 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  28.7 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  35.82 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  30.97 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  28.69 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  30.53 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  28.46 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  31.09 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  35.82 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  47.06 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  35.19 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  39.29 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  28.92 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  39.29 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2353  DNA polymerase beta domain protein region  47.5 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  31.3 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 270 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 189 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  40.32 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  28.3 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  27.83 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  36.21 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 129 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 104 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>