225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2925 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  100 
 
 		 418 aa  831    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  78.47 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  54.07 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  34.77 
 
 		 413 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  33.72 
 
 		 479 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  34.18 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  33.95 
 
 		 470 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  34.94 
 
 		 445 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  33.72 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  34.51 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  28.51 
 
 		 495 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  28.05 
 
 		 495 aa  146  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  31.51 
 
 		 466 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  33.49 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.05 
 
 		 436 aa  126  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  27.49 
 
 		 422 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.28 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  35.17 
 
 		 426 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  31.44 
 
 		 415 aa  116  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  31.53 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  29.67 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  29.9 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  29.23 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  29.19 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  29.68 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  31.67 
 
 		 423 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.94 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  29.44 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  30.83 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  30.11 
 
 		 1199 aa  106  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  28.75 
 
 		 419 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  31.38 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  30.43 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  30.12 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  27.29 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  28.85 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.11 
 
 		 478 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.11 
 
 		 478 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  31.17 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  26.67 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.12 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  30.08 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  24.68 
 
 		 478 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  28.33 
 
 		 480 aa  86.7  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  28.82 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.6 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  24.57 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  30.53 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  27.07 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  28.57 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  28.18 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  28.4 
 
 		 1274 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  24.36 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  26.35 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  25.97 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  29.8 
 
 		 999 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  32.69 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  29.81 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  30.34 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  27.85 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.05 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  26.32 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.05 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  27.79 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  25.81 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  23.9 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  25.6 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  24.25 
 
 		 536 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  26.43 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.42 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  29.77 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.34 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  32.12 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.42 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.49 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  28.46 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.27 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  25.43 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.37 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  29.38 
 
 		 628 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  29.95 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  26.32 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.18 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.92 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  28.96 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  24.95 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  28.51 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  27.65 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  27.16 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.67 
 
 		 592 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25.06 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30.58 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  27.23 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  29.7 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  27.23 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.45 
 
 		 625 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>