More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2921 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
868 aa  1753    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.45 
 
 
764 aa  654    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  81.87 
 
 
862 aa  1390    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.95 
 
 
764 aa  684    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  44.9 
 
 
764 aa  647    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.4 
 
 
778 aa  602  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  39.16 
 
 
912 aa  588  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.49 
 
 
815 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.59 
 
 
763 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.53 
 
 
804 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.95 
 
 
802 aa  562  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  42.53 
 
 
795 aa  562  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.57 
 
 
807 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.09 
 
 
775 aa  558  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.84 
 
 
807 aa  552  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.77 
 
 
806 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.57 
 
 
824 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.5 
 
 
848 aa  548  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.01 
 
 
764 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.77 
 
 
739 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.15 
 
 
781 aa  545  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  43.28 
 
 
798 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
815 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  41.86 
 
 
751 aa  538  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  43.22 
 
 
865 aa  538  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  45.66 
 
 
804 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  41.73 
 
 
795 aa  535  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.96 
 
 
941 aa  531  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  43.97 
 
 
771 aa  528  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.5 
 
 
762 aa  527  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42 
 
 
773 aa  528  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  40.78 
 
 
833 aa  522  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.48 
 
 
764 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  42.64 
 
 
761 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.77 
 
 
973 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.4 
 
 
782 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.41 
 
 
1053 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.21 
 
 
972 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.69 
 
 
807 aa  512  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.11 
 
 
751 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.88 
 
 
962 aa  512  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  38.11 
 
 
891 aa  511  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.04 
 
 
761 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.67 
 
 
868 aa  509  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  42 
 
 
780 aa  508  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.93 
 
 
775 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.18 
 
 
753 aa  506  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.8 
 
 
775 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.8 
 
 
775 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.88 
 
 
861 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  38.32 
 
 
986 aa  502  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.43 
 
 
959 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.19 
 
 
790 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.92 
 
 
758 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.91 
 
 
752 aa  489  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  36.86 
 
 
831 aa  488  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  37.59 
 
 
815 aa  488  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.24 
 
 
803 aa  486  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.07 
 
 
1086 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.27 
 
 
808 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.1 
 
 
829 aa  475  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.92 
 
 
812 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.84 
 
 
805 aa  472  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.34 
 
 
768 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  37.96 
 
 
797 aa  463  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.04 
 
 
759 aa  459  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.33 
 
 
789 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
738 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.42 
 
 
790 aa  452  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  34.58 
 
 
1210 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.64 
 
 
896 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.69 
 
 
685 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.62 
 
 
855 aa  395  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  34.49 
 
 
758 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  43.61 
 
 
866 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  0.000025981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.17 
 
 
902 aa  364  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  32.75 
 
 
931 aa  347  4e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.96 
 
 
1198 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.21 
 
 
803 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  28.19 
 
 
1178 aa  320  1e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  31.8 
 
 
948 aa  314  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.3 
 
 
897 aa  298  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.36 
 
 
744 aa  293  9e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.92 
 
 
756 aa  289  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.01 
 
 
744 aa  283  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  28.03 
 
 
1321 aa  281  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.66 
 
 
751 aa  274  7e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.53 
 
 
744 aa  272  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.4 
 
 
766 aa  271  5e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.62 
 
 
838 aa  269  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.83 
 
 
744 aa  267  8e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.51 
 
 
739 aa  264  6.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  25.72 
 
 
905 aa  256  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.9 
 
 
740 aa  245  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.36 
 
 
815 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.48 
 
 
914 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.26 
 
 
911 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  27.46 
 
 
906 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.78 
 
 
876 aa  166  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 
879 aa  165  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>