230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2837 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2837  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00762998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0663  hypothetical protein  85.48 
 
 		 139 aa  222  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3149  protein of unknown function DUF59  79.09 
 
 		 131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.894372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2656  hypothetical protein  57.14 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.496157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  39.33 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  37.11 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  38.61 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  33.33 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  36.73 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  35.71 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  33.67 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  36.84 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  34.69 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  33 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  35.16 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  36.67 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  32.65 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  35.35 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  35.05 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2860  hypothetical protein  36.73 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  35.05 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  38.3 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  32 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  33.67 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  32.65 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1701  hypothetical protein  35.87 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.782765  normal  0.0606512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  35.71 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  31.25 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  32.65 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  31.25 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  31.25 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  31.58 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  32.26 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  31.96 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  31.25 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  32.26 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  31.96 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2866  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  34.34 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  32.26 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  32.26 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  33.33 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  35.37 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  33.67 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1982  serine O-acetyltransferase  34.78 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1915  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  38 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.844425  normal  0.11814 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  30.11 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  30.21 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  29.17 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  34.41 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  31.18 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  38.14 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  30.11 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  32.65 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  34.38 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  31.91 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  31.73 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  34.34 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  32.65 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  29.03 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  32.99 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  32.32 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  32.65 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  30.93 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  34.38 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  31.25 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  28.75 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  32.61 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  30.39 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  30.21 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  31.63 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  31.63 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  32.29 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  32.35 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  34 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  30.61 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  31.31 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  30.61 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  32.67 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  32.65 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  35.8 
 
 		 353 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  29.52 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2421  serine O-acetyltransferase  32.56 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.710192  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  32.99 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0541  hypothetical protein  27 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0982669  normal  0.227881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  33.67 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  33.71 
 
 		 356 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  28.12 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1319  protein of unknown function DUF59  21.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  31.11 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  34.57 
 
 		 353 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1951  hypothetical protein  31.96 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>