12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2792 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  180  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2570  hypothetical protein  74.42 
 
 		 86 aa  137  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2694  hypothetical protein  35.06 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  42.22 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2794  hypothetical protein  42.22 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  34.94 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  30.88 
 
 		 329 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  26.92 
 
 		 360 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  40.82 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  41.18 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  38.78 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0334  putative transmembrane anti-sigma factor  27.03 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>