243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2753 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  84.11 
 
 
938 aa  1575  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
952 aa  1937  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.68 
 
 
933 aa  914  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  43.62 
 
 
931 aa  743  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.24 
 
 
929 aa  991  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  41.44 
 
 
906 aa  628  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.99 
 
 
946 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.99 
 
 
946 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.99 
 
 
946 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.1 
 
 
937 aa  597  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.6 
 
 
933 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.06 
 
 
936 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.98 
 
 
928 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.54 
 
 
950 aa  592  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.09332e-07 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.68 
 
 
945 aa  582  1e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.52 
 
 
949 aa  583  1e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.7 
 
 
1001 aa  582  1e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.09 
 
 
921 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.69 
 
 
937 aa  580  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.76 
 
 
1002 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.27 
 
 
926 aa  582  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.2 
 
 
929 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.41 
 
 
929 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.61 
 
 
947 aa  577  1e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
936 aa  578  1e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.95 
 
 
896 aa  576  1e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.53 
 
 
933 aa  578  1e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.14 
 
 
928 aa  573  1e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.14 
 
 
938 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.34 
 
 
957 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.29 
 
 
923 aa  571  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.56 
 
 
951 aa  571  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.27 
 
 
918 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.4 
 
 
985 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.32 
 
 
1018 aa  563  1e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
994 aa  565  1e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
994 aa  564  1e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
994 aa  564  1e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
994 aa  564  1e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
994 aa  564  1e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.72 
 
 
1004 aa  565  1e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
1024 aa  563  1e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.82 
 
 
1085 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.99 
 
 
929 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  1.74255e-10 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.88 
 
 
949 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.84 
 
 
982 aa  562  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.88 
 
 
949 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.15 
 
 
930 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.48 
 
 
970 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.99 
 
 
929 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.72 
 
 
1088 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.67 
 
 
1009 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.28 
 
 
1017 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.78 
 
 
1009 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.79 
 
 
998 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.67 
 
 
994 aa  559  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.21 
 
 
954 aa  559  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.41 
 
 
947 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
896 aa  554  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.9 
 
 
934 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.79 
 
 
998 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.54 
 
 
932 aa  555  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.51 
 
 
946 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.32 
 
 
898 aa  550  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.52 
 
 
915 aa  548  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.01 
 
 
898 aa  547  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.36 
 
 
1008 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.37 
 
 
1030 aa  545  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.47 
 
 
892 aa  545  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.52 
 
 
937 aa  545  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.27 
 
 
1023 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.19 
 
 
1017 aa  541  1e-152  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.55 
 
 
938 aa  540  1e-152  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.14 
 
 
939 aa  541  1e-152  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.81 
 
 
954 aa  542  1e-152  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.76 
 
 
1075 aa  542  1e-152  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.89 
 
 
920 aa  540  1e-152  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.8 
 
 
1038 aa  541  1e-152  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.64 
 
 
1021 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.81 
 
 
940 aa  539  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.11 
 
 
994 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.55 
 
 
929 aa  535  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.45 
 
 
897 aa  535  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.1 
 
 
994 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.07 
 
 
900 aa  534  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.71 
 
 
883 aa  535  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.16 
 
 
1002 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.99 
 
 
994 aa  532  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.61 
 
 
892 aa  530  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.14 
 
 
831 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.06 
 
 
1007 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.81 
 
 
997 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 
1024 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.8 
 
 
981 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.19 
 
 
939 aa  525  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 
1024 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.35 
 
 
995 aa  522  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.91 
 
 
898 aa  520  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.1 
 
 
1009 aa  522  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.46 
 
 
957 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>