98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2737 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  39.79 
 
 		 2888 aa  1977    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  41.56 
 
 		 2860 aa  2120    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  44.09 
 
 		 2761 aa  2001    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  39.34 
 
 		 2823 aa  2050    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  43.82 
 
 		 2842 aa  2142    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  47.11 
 
 		 3021 aa  1332    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  39.07 
 
 		 2833 aa  1857    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.32 
 
 		 2864 aa  1990    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  100 
 
 		 2864 aa  5778    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  42.46 
 
 		 1303 aa  1014    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  39.37 
 
 		 2870 aa  1843    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  44.27 
 
 		 2916 aa  2310    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  49.5 
 
 		 2748 aa  1472    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  44.91 
 
 		 2875 aa  2168    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  86.37 
 
 		 2864 aa  4953    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  45.16 
 
 		 2874 aa  2133    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  43.04 
 
 		 2880 aa  2185    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  44.53 
 
 		 2881 aa  2254    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  45.4 
 
 		 2453 aa  796    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  39.67 
 
 		 2730 aa  1019    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  40.61 
 
 		 2887 aa  2258    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  37.74 
 
 		 2839 aa  1793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  44.63 
 
 		 2901 aa  2182    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  47.27 
 
 		 2929 aa  1448    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.86 
 
 		 2732 aa  1960    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  44.95 
 
 		 2932 aa  2296    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  46.1 
 
 		 2859 aa  2315    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  44.37 
 
 		 2769 aa  2065    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  44.38 
 
 		 2905 aa  2302    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  49.16 
 
 		 2748 aa  1398    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  39.81 
 
 		 2786 aa  1981    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  49.66 
 
 		 2758 aa  1420    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  37.54 
 
 		 2793 aa  1607    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  44.49 
 
 		 2922 aa  1437    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  44.13 
 
 		 2868 aa  2140    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  44.86 
 
 		 2845 aa  2209    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  44.77 
 
 		 2868 aa  2150    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  37.99 
 
 		 2839 aa  1783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  42.45 
 
 		 2716 aa  1173    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  45.16 
 
 		 2831 aa  2140    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  39.04 
 
 		 2779 aa  1731    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  39.36 
 
 		 2731 aa  1045    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  37.77 
 
 		 2884 aa  1893    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  49.85 
 
 		 2747 aa  1469    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  51.14 
 
 		 624 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  41.34 
 
 		 849 aa  551  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  36.76 
 
 		 786 aa  530  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  31.14 
 
 		 785 aa  327  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  29.82 
 
 		 784 aa  327  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  27.82 
 
 		 801 aa  323  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  29.48 
 
 		 822 aa  322  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  28.25 
 
 		 784 aa  320  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  27.94 
 
 		 790 aa  316  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  27.66 
 
 		 802 aa  316  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  27.66 
 
 		 802 aa  315  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  27.54 
 
 		 762 aa  308  8.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  28.82 
 
 		 811 aa  305  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  28.04 
 
 		 813 aa  304  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  28.42 
 
 		 811 aa  304  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  28.04 
 
 		 813 aa  304  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  27.68 
 
 		 797 aa  303  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  29.18 
 
 		 815 aa  301  9e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  27.5 
 
 		 811 aa  300  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  28.42 
 
 		 811 aa  300  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  28.07 
 
 		 819 aa  298  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  29.34 
 
 		 822 aa  298  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  29.48 
 
 		 794 aa  293  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  27.97 
 
 		 829 aa  291  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  26.08 
 
 		 831 aa  286  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  27.24 
 
 		 809 aa  284  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  28.89 
 
 		 823 aa  283  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  28.17 
 
 		 815 aa  281  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  28.87 
 
 		 797 aa  281  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  28.55 
 
 		 827 aa  274  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  25.57 
 
 		 797 aa  272  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  27 
 
 		 811 aa  272  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  25.28 
 
 		 796 aa  258  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  26.74 
 
 		 824 aa  256  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  27.63 
 
 		 788 aa  244  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  27.39 
 
 		 801 aa  202  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  24.7 
 
 		 802 aa  188  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.84 
 
 		 984 aa  97.1  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  22.88 
 
 		 900 aa  83.2  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  27.04 
 
 		 536 aa  77  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  23.13 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1100 aa  69.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  21.02 
 
 		 904 aa  69.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  25 
 
 		 536 aa  68.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1136 aa  64.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  26.46 
 
 		 754 aa  64.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1094 aa  65.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1169 aa  60.1  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1076 aa  57  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  23.88 
 
 		 1145 aa  54.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  26.27 
 
 		 459 aa  50.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  25.81 
 
 		 459 aa  48.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 488 aa  48.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  25.81 
 
 		 459 aa  48.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>