289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2714 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  38.31 
 
 
1084 aa  668  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  39.52 
 
 
1033 aa  686  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.36 
 
 
1026 aa  645  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  40.56 
 
 
1022 aa  664  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  82.84 
 
 
1043 aa  1733  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  38.32 
 
 
1084 aa  664  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  100 
 
 
1020 aa  2091  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  38.58 
 
 
1063 aa  678  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.98 
 
 
1041 aa  649  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  35.32 
 
 
1024 aa  627  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  36.5 
 
 
1129 aa  625  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  37.1 
 
 
1044 aa  613  1e-174  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
1049 aa  609  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  33.24 
 
 
1043 aa  608  1e-172  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  37.27 
 
 
1164 aa  608  1e-172  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  36.42 
 
 
1035 aa  607  1e-172  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  35.69 
 
 
1041 aa  599  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  38.37 
 
 
1017 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  38.24 
 
 
1036 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  33.93 
 
 
1079 aa  586  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  37.61 
 
 
1043 aa  582  1e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 
1094 aa  584  1e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.36 
 
 
1018 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  37.65 
 
 
1043 aa  576  1e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  36.63 
 
 
1028 aa  578  1e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  6.20353e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  37.17 
 
 
1032 aa  575  1e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  37.72 
 
 
1024 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.44327e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  37.72 
 
 
1024 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.19694e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  36.28 
 
 
1029 aa  571  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  37.68 
 
 
1024 aa  572  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.67859e-06  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  34.6 
 
 
1023 aa  569  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  35.91 
 
 
1050 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  33.88 
 
 
1019 aa  568  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  37.77 
 
 
1003 aa  567  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  37.2 
 
 
1024 aa  563  1e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.45928e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  35.5 
 
 
1066 aa  565  1e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.3 
 
 
1024 aa  564  1e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  8.77394e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  35.6 
 
 
1066 aa  565  1e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  37.3 
 
 
1024 aa  564  1e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.75259e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  32.35 
 
 
1455 aa  563  1e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  37.3 
 
 
1024 aa  564  1e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.6518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  35.16 
 
 
1076 aa  562  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  33.05 
 
 
1045 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  34.25 
 
 
1035 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  34.15 
 
 
1045 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.94 
 
 
1030 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  34.22 
 
 
1036 aa  554  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.2 
 
 
1030 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  33.8 
 
 
1030 aa  555  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.94 
 
 
1030 aa  555  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.49 
 
 
1030 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  33.8 
 
 
1030 aa  555  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.04 
 
 
1030 aa  555  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.94 
 
 
1030 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  34.8 
 
 
1077 aa  552  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  36.71 
 
 
1024 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.41482e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  34.97 
 
 
1059 aa  548  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  7.51059e-10 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.82 
 
 
1030 aa  545  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.49 
 
 
1264 aa  537  1e-151  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  9.54733e-05  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  32.46 
 
 
1046 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.56 
 
 
1033 aa  538  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.33 
 
 
1036 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.65 
 
 
1053 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.33 
 
 
968 aa  532  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  31.89 
 
 
1108 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  33.5 
 
 
1032 aa  529  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  34.95 
 
 
1112 aa  522  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.39 
 
 
1030 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  32.84 
 
 
1031 aa  511  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  32.57 
 
 
1030 aa  512  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  36.79 
 
 
1020 aa  508  1e-142  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.61 
 
 
992 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.64 
 
 
1013 aa  493  1e-138  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.36 
 
 
1003 aa  493  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.79 
 
 
1004 aa  489  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.23 
 
 
1329 aa  476  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  28.8 
 
 
1009 aa  468  1e-130  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.04 
 
 
1289 aa  465  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  28.72 
 
 
1012 aa  461  1e-128  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  32 
 
 
1017 aa  461  1e-128  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.36 
 
 
992 aa  455  1e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  30.14 
 
 
1021 aa  451  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  31.36 
 
 
1026 aa  448  1e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.62 
 
 
996 aa  439  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.49 
 
 
1005 aa  435  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  33.2 
 
 
1012 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  31.93 
 
 
1008 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  32.04 
 
 
1023 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
640 aa  343  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.75 
 
 
1424 aa  322  2e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  32.76 
 
 
628 aa  303  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.48878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.49 
 
 
1600 aa  270  9e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  41.58 
 
 
349 aa  244  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.78 
 
 
920 aa  223  1e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 
987 aa  222  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.33 
 
 
972 aa  198  4e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  21.97 
 
 
951 aa  186  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.68 
 
 
920 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46582  predicted protein  29.13 
 
 
561 aa  169  3e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 
754 aa  142  2e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>