More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2694 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  51.43 
 
 
981 aa  835    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  82.9 
 
 
971 aa  1551    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
969 aa  1917    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.4 
 
 
1020 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
531 aa  178  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  39.91 
 
 
614 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
958 aa  170  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  31.27 
 
 
903 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  41.63 
 
 
284 aa  155  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 
864 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  37.44 
 
 
638 aa  145  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
859 aa  144  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.76 
 
 
611 aa  144  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  35.14 
 
 
665 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 
858 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  35.85 
 
 
513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  35.78 
 
 
641 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
702 aa  141  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 
860 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  27.3 
 
 
911 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  34.8 
 
 
518 aa  134  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  35.86 
 
 
746 aa  134  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  36.4 
 
 
515 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.9 
 
 
861 aa  131  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  36.79 
 
 
380 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  35.71 
 
 
518 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
523 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 
2153 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  34.63 
 
 
632 aa  130  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 
364 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 
645 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  31.73 
 
 
702 aa  127  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 
817 aa  127  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  36.32 
 
 
582 aa  127  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.27 
 
 
528 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.96 
 
 
879 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.53 
 
 
758 aa  125  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  34.6 
 
 
607 aa  124  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 
632 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.16 
 
 
585 aa  124  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1631 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 
479 aa  124  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.19 
 
 
701 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  32.76 
 
 
794 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 
381 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  36.98 
 
 
1207 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  30.89 
 
 
431 aa  121  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
887 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.64 
 
 
815 aa  120  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
725 aa  120  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  31.3 
 
 
441 aa  120  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 
735 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  34.42 
 
 
529 aa  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  32.02 
 
 
738 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
403 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  33.2 
 
 
358 aa  119  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  34.36 
 
 
822 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
566 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.27 
 
 
696 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  30.83 
 
 
546 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
696 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
361 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.04 
 
 
597 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.04 
 
 
672 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.45 
 
 
656 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.49 
 
 
737 aa  115  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.55 
 
 
758 aa  115  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 
675 aa  115  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.22 
 
 
761 aa  115  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  30.24 
 
 
483 aa  114  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.33 
 
 
584 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  34.25 
 
 
670 aa  114  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  35.16 
 
 
421 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 
526 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.29 
 
 
1017 aa  114  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.33 
 
 
584 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.24 
 
 
483 aa  114  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  48.76 
 
 
382 aa  114  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  42.22 
 
 
549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 
439 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 
591 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.87 
 
 
734 aa  114  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  34.84 
 
 
514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 
3470 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  40.62 
 
 
705 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.85 
 
 
650 aa  113  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.73 
 
 
1081 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
752 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  31.08 
 
 
717 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
1651 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  38.79 
 
 
536 aa  112  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 
679 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
524 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.78 
 
 
604 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  30.7 
 
 
1134 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  30.14 
 
 
584 aa  112  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.08 
 
 
678 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.62 
 
 
648 aa  111  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  39.44 
 
 
532 aa  111  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 
447 aa  111  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>