204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2686 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2686  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1808  protein of unknown function DUF45  77.23 
 
 
111 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4387  hypothetical protein  77 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177424  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1669  metal-dependent hydrolase-like  68.09 
 
 
137 aa  135  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000580277 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1899  hypothetical protein  58.62 
 
 
92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1091  protein of unknown function DUF45  61.25 
 
 
91 aa  104  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00838265  normal  0.159075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1094  protein of unknown function DUF45  55.91 
 
 
114 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0312  protein of unknown function DUF45  46.07 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.137336 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3111  metal-dependent hydrolase  48.19 
 
 
120 aa  84.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0228  hypothetical protein  46.99 
 
 
151 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0259  hypothetical protein  45.78 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0338  protein of unknown function DUF45  44.94 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.860406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1155  metal-dependent hydrolase-like  56.96 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439664  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0142  protein of unknown function DUF45  50 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596952  normal  0.717523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1174  hypothetical protein  45.78 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  49.37 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  49.37 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1569  hypothetical protein  43.37 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184826  unclonable  0.0000116524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0842  hypothetical protein  45 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0970  protein of unknown function DUF45  45 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473345  normal  0.177309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  36.62 
 
 
237 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  32.22 
 
 
224 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  30.49 
 
 
241 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  36.84 
 
 
227 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.71 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  36.84 
 
 
227 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  39.73 
 
 
254 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  31.52 
 
 
224 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  35.62 
 
 
242 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  35.62 
 
 
224 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  31.25 
 
 
251 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  42.59 
 
 
232 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  36.76 
 
 
242 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  27.16 
 
 
244 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  31.94 
 
 
246 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  38.36 
 
 
233 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  33.8 
 
 
238 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1624  hypothetical protein  35.62 
 
 
187 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.594523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  38.24 
 
 
239 aa  53.9  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  34.69 
 
 
221 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  33.71 
 
 
231 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  45.45 
 
 
242 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  36.47 
 
 
247 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  35.62 
 
 
241 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  30.86 
 
 
221 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  35.62 
 
 
260 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  37.31 
 
 
234 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  36.99 
 
 
198 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  38.16 
 
 
241 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  35.44 
 
 
244 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  33.33 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  36.36 
 
 
253 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  37.1 
 
 
215 aa  50.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  35.21 
 
 
237 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  34.72 
 
 
285 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  37.5 
 
 
223 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  38.98 
 
 
261 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  26.67 
 
 
262 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  37.33 
 
 
239 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 
184 aa  50.4  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  32.47 
 
 
240 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  38.37 
 
 
242 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  29.33 
 
 
225 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  40.3 
 
 
265 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  36.21 
 
 
244 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  32.47 
 
 
240 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  32.31 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  31.58 
 
 
245 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  32.84 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  35.94 
 
 
231 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  37.29 
 
 
240 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  38.33 
 
 
252 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  32.88 
 
 
251 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
292 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  34.62 
 
 
202 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
292 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  32.1 
 
 
241 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  40.35 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  31.88 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  40 
 
 
238 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  24.47 
 
 
243 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>