More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2677 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  46.65 
 
 
1039 aa  769    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  71.17 
 
 
1267 aa  1808    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
1267 aa  2572    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  52.01 
 
 
337 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0373  hexosyltransferase  37.6 
 
 
389 aa  257  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0375  hexosyltransferase  32.63 
 
 
390 aa  213  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1582  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
394 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2693  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
421 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1230  glycosyl transferase, group 1  37.17 
 
 
413 aa  185  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
401 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 
300 aa  157  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 
303 aa  155  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  41.06 
 
 
305 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
302 aa  144  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
616 aa  140  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  36.29 
 
 
291 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
298 aa  138  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
279 aa  131  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
1340 aa  129  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
318 aa  128  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
346 aa  125  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  36 
 
 
320 aa  124  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
841 aa  124  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  33.33 
 
 
283 aa  121  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
366 aa  121  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
822 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
331 aa  119  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
679 aa  118  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
286 aa  118  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
703 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
624 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
683 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  33.78 
 
 
700 aa  116  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
525 aa  116  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
291 aa  116  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
1739 aa  115  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
341 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
282 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
994 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
294 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 
313 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  34.03 
 
 
2401 aa  110  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  33.78 
 
 
330 aa  108  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
1106 aa  108  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
303 aa  108  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
310 aa  108  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  33.92 
 
 
288 aa  107  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
340 aa  107  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
293 aa  107  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  35.4 
 
 
632 aa  106  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
306 aa  106  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 
691 aa  105  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  31.2 
 
 
338 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
334 aa  105  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  32.53 
 
 
838 aa  105  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
305 aa  105  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 
324 aa  105  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
836 aa  104  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 
324 aa  104  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
722 aa  104  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
382 aa  104  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
691 aa  104  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
346 aa  104  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
721 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  28.82 
 
 
342 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
617 aa  103  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
314 aa  103  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
318 aa  103  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
691 aa  102  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  30.26 
 
 
860 aa  102  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
381 aa  102  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
330 aa  102  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
1152 aa  101  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
311 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
717 aa  101  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
327 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
306 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
728 aa  100  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
1523 aa  100  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
310 aa  100  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
892 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  30.31 
 
 
325 aa  100  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
290 aa  100  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
299 aa  100  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
775 aa  100  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
635 aa  100  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
308 aa  99.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
297 aa  99.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
300 aa  99.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1759 aa  100  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
717 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
340 aa  99.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
317 aa  99.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
324 aa  98.6  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
489 aa  99  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
880 aa  99  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
327 aa  98.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
337 aa  98.2  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
340 aa  98.2  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
319 aa  97.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>