69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2616 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  85.38 
 
 		 465 aa  807    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  942    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  61.21 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  53.98 
 
 		 453 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  46.57 
 
 		 475 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1453  hypothetical protein  44.26 
 
 		 474 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  27.82 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  26.04 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  23.68 
 
 		 454 aa  110  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3475  hypothetical protein  28.14 
 
 		 446 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3559  hypothetical protein  27.66 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.901378  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  22.7 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3627  hypothetical protein  27.66 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.839093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0461  hypothetical protein  27 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  26.09 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4990  hypothetical protein  26.61 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  28.46 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  27.63 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  29.93 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  25.22 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  26.88 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  26.01 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  25 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  27.33 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2485  hypothetical protein  28.5 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  22.74 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  26.79 
 
 		 482 aa  57  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  25.6 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  24.38 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  24.72 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  24.27 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  24.84 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  27.03 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  23.34 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1086  hypothetical protein  25.12 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4992  hypothetical protein  31.54 
 
 		 454 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  23.82 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  23.82 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  25.14 
 
 		 865 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  22.65 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0673  hypothetical protein  39.09 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  25.28 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1117  hypothetical protein  39.09 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2400  hypothetical protein  39.09 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  26.62 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0792  hypothetical protein  39.09 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40428  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1195  hypothetical protein  39.09 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276342  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1756  hypothetical protein  39.09 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  23.5 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  23.39 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3586  hypothetical protein  25.34 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000666104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  23.67 
 
 		 479 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1590  hypothetical protein  37.19 
 
 		 409 aa  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  21.68 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3971  hypothetical protein  28.16 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0844956  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  24.66 
 
 		 526 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  24.45 
 
 		 481 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2668  hypothetical protein  28.02 
 
 		 456 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519412  decreased coverage  0.0000451664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  26.13 
 
 		 507 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  23.83 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  24.78 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  21.93 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  21.92 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  24.19 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  25.35 
 
 		 482 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  23.21 
 
 		 485 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  24.28 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  26.05 
 
 		 488 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  22.62 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>