More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2583 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  82.38 
 
 		 1914 aa  2016    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1714 aa  3399    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 1596 aa  599  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 1313 aa  273  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1238 aa  271  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  31.8 
 
 		 782 aa  249  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1450 aa  201  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.59 
 
 		 1424 aa  196  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1261 aa  191  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 1101 aa  179  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1526 aa  174  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1060 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1105 aa  161  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.34 
 
 		 991 aa  160  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  23.52 
 
 		 1180 aa  155  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 924 aa  150  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2620  Tetratricopeptide TPR_4  36.78 
 
 		 303 aa  147  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.866097  normal  0.0216756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  21.14 
 
 		 1266 aa  140  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.97 
 
 		 985 aa  138  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.54 
 
 		 957 aa  138  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1063 aa  134  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1088 aa  132  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.33 
 
 		 1279 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 454 aa  128  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.69 
 
 		 636 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 412 aa  126  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.66 
 
 		 1009 aa  125  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  31.94 
 
 		 490 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  29.57 
 
 		 945 aa  117  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  27.79 
 
 		 694 aa  116  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1285 aa  115  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  23.9 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.12 
 
 		 836 aa  109  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 		 284 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.8 
 
 		 740 aa  108  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1082 aa  103  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.17 
 
 		 725 aa  104  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  26.83 
 
 		 2327 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  19.85 
 
 		 941 aa  104  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 649 aa  103  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 408 aa  102  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5126  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1531 aa  102  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 343 aa  102  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.51 
 
 		 1291 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.43 
 
 		 828 aa  99.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  27.16 
 
 		 834 aa  99.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.12 
 
 		 1040 aa  99.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  29.58 
 
 		 1429 aa  99.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 568 aa  99  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.53 
 
 		 568 aa  99  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  23.26 
 
 		 816 aa  97.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.27 
 
 		 1162 aa  97.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 809 aa  97.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 1290 aa  97.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 		 787 aa  97.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.85 
 
 		 825 aa  96.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  19.27 
 
 		 1162 aa  96.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.26 
 
 		 755 aa  96.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 953 aa  96.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  24.29 
 
 		 1022 aa  96.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.69 
 
 		 828 aa  95.5  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 1911 aa  94  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.91 
 
 		 1295 aa  93.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1197 aa  93.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.17 
 
 		 609 aa  93.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  24.74 
 
 		 364 aa  91.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.5 
 
 		 1186 aa  91.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  32.58 
 
 		 848 aa  91.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.72 
 
 		 689 aa  90.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  20.06 
 
 		 2145 aa  90.9  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  26.99 
 
 		 979 aa  90.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 		 911 aa  90.5  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.06 
 
 		 493 aa  89  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 776 aa  89  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 438 aa  88.6  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 1071 aa  87.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.41 
 
 		 999 aa  86.3  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 852 aa  86.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 760 aa  85.5  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1444  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 181 aa  85.5  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  27.87 
 
 		 807 aa  84.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  26.8 
 
 		 1021 aa  84  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 		 1123 aa  84  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.05 
 
 		 809 aa  84.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 751 aa  82.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.83 
 
 		 991 aa  82.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2043  tetratricopeptide domain-containing protein  23.11 
 
 		 1497 aa  82  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  31 
 
 		 1611 aa  82  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1215 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  26.48 
 
 		 708 aa  81.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.66 
 
 		 943 aa  81.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  25.75 
 
 		 806 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  30.58 
 
 		 954 aa  80.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1020 aa  79.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1916  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1172 aa  79.7  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.506674  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 850 aa  79.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 1048 aa  78.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1298 aa  78.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>