175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2557 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2557  dihydroorotase  100 
 
 		 339 aa  690    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1848  dihydroorotase  88.75 
 
 		 367 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.100177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0190  dihydroorotase  68.1 
 
 		 330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.934033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1778  dihydroorotase  64.4 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22752  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2027  dihydroorotase  61.7 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191556 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0624  dihydroorotase  57.62 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.841331  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0309  dihydroorotase  54.43 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311642  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0041  dihydroorotase  54.1 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0286  dihydroorotase  54.98 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1722  dihydroorotase  54.38 
 
 		 335 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.798231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  44.97 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  41.69 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  43.95 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  42.77 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  44.15 
 
 		 353 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  43.86 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  42.9 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  43.11 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  43.4 
 
 		 348 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  42.77 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  42.98 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  43.03 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  42.94 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  43.07 
 
 		 348 aa  235  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  42.26 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  41 
 
 		 351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  44.38 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  42.82 
 
 		 348 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  43.11 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  41.64 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  42.18 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  43.11 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  42.14 
 
 		 344 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  42.82 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  40.52 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  42.82 
 
 		 348 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  41.96 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  42.69 
 
 		 348 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  39.76 
 
 		 342 aa  232  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  43.15 
 
 		 352 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  39.35 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  40.23 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  41.98 
 
 		 378 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  43.73 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  43.24 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  41.98 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  41.98 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  41.98 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  42.27 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  41.98 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  41.98 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  41.42 
 
 		 345 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  41.59 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  40.12 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  40.12 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  40.12 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  41.25 
 
 		 343 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  42.94 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  41.59 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  40.41 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  41 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  41 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  42.06 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  41.19 
 
 		 347 aa  226  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  41.76 
 
 		 354 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  40.06 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  41.35 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  40.83 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  40.83 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  39 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  41.23 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  41.42 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  41.06 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  41.37 
 
 		 344 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  41.06 
 
 		 364 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  41.06 
 
 		 364 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  39.94 
 
 		 342 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4467  dihydroorotase  41.3 
 
 		 347 aa  222  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  42.18 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  40.76 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  39.64 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  40.92 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  38.76 
 
 		 355 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  40.41 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  36.98 
 
 		 348 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  39.82 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  40.72 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  39.64 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  40.12 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  39.94 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  40.36 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  42.44 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  40.42 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  38.89 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3035  dihydroorotase  38.25 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  40.71 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  39.35 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0106  dihydroorotase  41.32 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  40.71 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2893  dihydroorotase  38.25 
 
 		 345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>