175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2538 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  37.99 
 
 		 1282 aa  832    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  56.88 
 
 		 1422 aa  794    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  100 
 
 		 1243 aa  2469    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  38.01 
 
 		 1290 aa  840    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  42.23 
 
 		 1339 aa  592  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  48.31 
 
 		 1373 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  44.69 
 
 		 1333 aa  575  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  37.43 
 
 		 1712 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  37.23 
 
 		 1355 aa  509  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  39.68 
 
 		 1336 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  37.76 
 
 		 1354 aa  446  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  39.4 
 
 		 1306 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  37.05 
 
 		 1440 aa  433  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1363 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1346 aa  425  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  36 
 
 		 1461 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1409 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1342 aa  416  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1452 aa  406  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  38.22 
 
 		 1322 aa  399  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  37.74 
 
 		 1459 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1321 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  39.19 
 
 		 1331 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  34.47 
 
 		 1347 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  36.55 
 
 		 1318 aa  389  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  36.24 
 
 		 1338 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1365 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  34.06 
 
 		 1353 aa  376  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  35.79 
 
 		 1358 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  32.73 
 
 		 1343 aa  362  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  35.74 
 
 		 1319 aa  361  5e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  36.65 
 
 		 1322 aa  358  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  32.25 
 
 		 1441 aa  344  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1366 aa  344  7e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  31.6 
 
 		 1321 aa  340  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  40.51 
 
 		 536 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1338 aa  324  7e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  40.57 
 
 		 1347 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1339 aa  304  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1339 aa  304  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  34.63 
 
 		 1219 aa  238  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  34.84 
 
 		 1055 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25 
 
 		 1432 aa  187  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  29.26 
 
 		 512 aa  175  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  29.3 
 
 		 978 aa  174  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1426 aa  149  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1250 aa  145  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1250 aa  145  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1612 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  29.33 
 
 		 925 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1581 aa  135  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1154 aa  135  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1151 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1098 aa  124  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  31.98 
 
 		 926 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  29.2 
 
 		 918 aa  121  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1546 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.04 
 
 		 1278 aa  119  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  27.36 
 
 		 1186 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  21.31 
 
 		 1277 aa  117  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1170 aa  110  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1332 aa  109  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1173 aa  109  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  41.49 
 
 		 846 aa  109  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1575 aa  108  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1579 aa  105  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  24.93 
 
 		 1581 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1572 aa  105  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  25 
 
 		 1188 aa  104  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1022 aa  103  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1642 aa  103  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1375 aa  102  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1644 aa  102  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1018 aa  102  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1640 aa  98.6  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1557 aa  98.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  22.4 
 
 		 1159 aa  97.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.53 
 
 		 974 aa  97.1  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.54 
 
 		 1573 aa  96.3  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1349 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1184 aa  94.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.77 
 
 		 1640 aa  93.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1709 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  28 
 
 		 1442 aa  90.1  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  25.1 
 
 		 869 aa  89.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  20.86 
 
 		 1089 aa  84  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  19.84 
 
 		 1186 aa  82.8  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  18.06 
 
 		 1257 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.01 
 
 		 995 aa  80.9  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.18 
 
 		 1252 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  27.12 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  25.67 
 
 		 838 aa  79.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  25.27 
 
 		 928 aa  79.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1751 aa  79  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  37.14 
 
 		 1041 aa  78.6  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  22.17 
 
 		 933 aa  78.2  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  28.74 
 
 		 973 aa  78.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  17.95 
 
 		 1244 aa  77  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1210 aa  76.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  30.2 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>