267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2519 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  599  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  86.98 
 
 		 316 aa  481  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.64 
 
 		 307 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.51 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  41.67 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.75 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.32 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  42.86 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.07 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  37.87 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  41.58 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.87 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.02 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  39.31 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  41.81 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  38.62 
 
 		 297 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  37.59 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.53 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.29 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.54 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.96 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.56 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  36.21 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  36.55 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  36.55 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  36.21 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  36.21 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  33.91 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.33 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.73 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  37.85 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  35.07 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  35.56 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  48 
 
 		 277 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  35.86 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  35.76 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  31.52 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  32.5 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  29.84 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  31.16 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  31.16 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  31.16 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  30.8 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  31.16 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  30.22 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  30.8 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  30.8 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  38.75 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  38.57 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.53 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  36.61 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  37.21 
 
 		 286 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  36.33 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  36.88 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  32.32 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.47 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  35.47 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28.67 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  32.88 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  31.97 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  31.95 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  25.57 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  35.49 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  32.62 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  30.7 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  27.04 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  28.67 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  26.65 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.16 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.16 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  29.51 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  31.25 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  31.25 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.32 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  29.39 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  29.89 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.68 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  32.43 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  32.43 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  27.6 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  32.13 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  27.85 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  28.87 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>