More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2450 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
738 aa  1474  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  59.32 
 
 
734 aa  821  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  85.07 
 
 
750 aa  1257  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  44.67 
 
 
783 aa  584  1e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  41.73 
 
 
767 aa  564  1e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  46.58 
 
 
713 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 
712 aa  541  1e-152  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  40.33 
 
 
712 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  40.47 
 
 
712 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  40.68 
 
 
735 aa  522  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  41.77 
 
 
707 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 
833 aa  516  1e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  43.11 
 
 
1022 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.93 
 
 
709 aa  512  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  40.54 
 
 
751 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  42.09 
 
 
984 aa  508  1e-142  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  42.09 
 
 
984 aa  508  1e-142  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  42.66 
 
 
799 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  43.01 
 
 
800 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  43.22 
 
 
904 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  44.05 
 
 
793 aa  493  1e-138  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
712 aa  494  1e-138  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  42 
 
 
720 aa  495  1e-138  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  42.51 
 
 
709 aa  494  1e-138  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  39.42 
 
 
713 aa  493  1e-138  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  42.18 
 
 
800 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  39.7 
 
 
812 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  43.27 
 
 
799 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  41.62 
 
 
844 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  39.45 
 
 
711 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  42.18 
 
 
800 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  45.52 
 
 
802 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  40.08 
 
 
785 aa  489  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  43.69 
 
 
737 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  43.31 
 
 
750 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.22 
 
 
718 aa  488  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  42.84 
 
 
750 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
750 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  39.79 
 
 
738 aa  483  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  43.32 
 
 
748 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  41.23 
 
 
939 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  45.08 
 
 
791 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  38.36 
 
 
825 aa  481  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  42.72 
 
 
742 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  42.23 
 
 
769 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  44.09 
 
 
673 aa  479  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 
744 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  41.9 
 
 
814 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  42.49 
 
 
750 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  41.47 
 
 
800 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.47 
 
 
800 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  42.39 
 
 
711 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  42.64 
 
 
752 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  41.62 
 
 
704 aa  475  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  43.05 
 
 
801 aa  471  1e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
926 aa  470  1e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  42.52 
 
 
799 aa  466  1e-130  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  38.9 
 
 
748 aa  468  1e-130  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  39.79 
 
 
734 aa  469  1e-130  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
726 aa  468  1e-130  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 
812 aa  468  1e-130  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  41.78 
 
 
800 aa  468  1e-130  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 
635 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
726 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.08 
 
 
739 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  38.49 
 
 
773 aa  466  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  43.76 
 
 
712 aa  460  1e-128  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  42.14 
 
 
972 aa  460  1e-128  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  41.83 
 
 
712 aa  460  1e-128  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  41.37 
 
 
723 aa  460  1e-128  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  38.92 
 
 
868 aa  459  1e-128  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  41.32 
 
 
734 aa  461  1e-128  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
832 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  46.01 
 
 
753 aa  458  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  42.68 
 
 
722 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
832 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
834 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
713 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
834 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  46.79 
 
 
713 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  46.79 
 
 
830 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
701 aa  455  1e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
728 aa  453  1e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  40.4 
 
 
764 aa  454  1e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
828 aa  452  1e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
740 aa  455  1e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  44.63 
 
 
709 aa  454  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  39.01 
 
 
768 aa  455  1e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  40.43 
 
 
794 aa  455  1e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  41.09 
 
 
758 aa  454  1e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  44.97 
 
 
762 aa  455  1e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
728 aa  453  1e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2915  heavy metal translocating P-type ATPase  44.86 
 
 
732 aa  452  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522074  normal  0.0959019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
740 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.37 
 
 
752 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  46.24 
 
 
866 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  38.67 
 
 
803 aa  446  1e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  38.85 
 
 
757 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  39.73 
 
 
768 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  40.31 
 
 
955 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>