More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2449 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  100 
 
 
411 aa  796  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  82.71 
 
 
401 aa  601  1e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  59.28 
 
 
401 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  57.51 
 
 
415 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  59.28 
 
 
401 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  59.28 
 
 
401 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  53.81 
 
 
397 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  56.99 
 
 
401 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  57.07 
 
 
388 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  4.03685e-05 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  52.53 
 
 
430 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.54 
 
 
407 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  59.02 
 
 
401 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  55.47 
 
 
425 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  58.76 
 
 
401 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  57.73 
 
 
403 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  54.17 
 
 
402 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  55.36 
 
 
409 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  55.76 
 
 
403 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  55.61 
 
 
403 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  56.92 
 
 
407 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  56.92 
 
 
407 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.92 
 
 
391 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  53.87 
 
 
408 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  50 
 
 
393 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  51.03 
 
 
393 aa  363  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  56.62 
 
 
398 aa  360  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  57.73 
 
 
408 aa  357  2e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  55.18 
 
 
403 aa  357  3e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  54.92 
 
 
403 aa  356  4e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  55.98 
 
 
426 aa  352  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  50.77 
 
 
393 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  53.77 
 
 
404 aa  348  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  50.26 
 
 
393 aa  348  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  51.05 
 
 
393 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.31811e-11 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  56.14 
 
 
401 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  50 
 
 
393 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01188e-09 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  55.26 
 
 
413 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  50.13 
 
 
393 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  50.51 
 
 
393 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  49.49 
 
 
393 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  56.88 
 
 
396 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  50.13 
 
 
412 aa  340  3e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.41 
 
 
408 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.41 
 
 
408 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  54.34 
 
 
430 aa  338  1e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  50.26 
 
 
393 aa  337  2e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  54.24 
 
 
405 aa  337  2e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.05 
 
 
403 aa  336  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  56.76 
 
 
417 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.22 
 
 
405 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  56.8 
 
 
401 aa  328  1e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.8 
 
 
443 aa  328  1e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.3 
 
 
411 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.3 
 
 
411 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.37 
 
 
400 aa  322  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  48.66 
 
 
346 aa  315  1e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.4 
 
 
411 aa  314  2e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  54.12 
 
 
392 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  54.1 
 
 
392 aa  308  1e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  52.86 
 
 
404 aa  303  4e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.84 
 
 
407 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.66 
 
 
404 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  54.62 
 
 
398 aa  292  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  51.24 
 
 
412 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  55.33 
 
 
407 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  46.7 
 
 
394 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  49.35 
 
 
394 aa  276  4e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  42.75 
 
 
395 aa  275  1e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  42.64 
 
 
383 aa  268  9e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  51.17 
 
 
387 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  41.73 
 
 
383 aa  263  5e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  50.91 
 
 
330 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  46.83 
 
 
379 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  42.05 
 
 
383 aa  253  5e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  43.82 
 
 
378 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  42.48 
 
 
386 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  43.42 
 
 
390 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  43.78 
 
 
387 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  43.39 
 
 
383 aa  245  1e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  41.84 
 
 
390 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  41.69 
 
 
390 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  40.28 
 
 
392 aa  236  5e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  41.52 
 
 
390 aa  235  1e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  40.25 
 
 
390 aa  233  4e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.74 
 
 
418 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  40.74 
 
 
418 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  40.74 
 
 
418 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  40.48 
 
 
382 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  43.13 
 
 
380 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  39.24 
 
 
404 aa  222  1e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  41.65 
 
 
402 aa  214  2e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  41.58 
 
 
381 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  64.56 
 
 
405 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  45.66 
 
 
416 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  31.65 
 
 
493 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  58.6 
 
 
158 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.84 
 
 
395 aa  163  4e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.27 
 
 
386 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  31.42 
 
 
476 aa  152  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.94 
 
 
379 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>