117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2433 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2433  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
497 aa  979    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000860113  decreased coverage  0.000244863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3046  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  71.23 
 
 
495 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.742448  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.32 
 
 
810 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
1297 aa  57  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
761 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
878 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
473 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  28.36 
 
 
545 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.75 
 
 
545 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00059  cell cycle control protein (Cwf23), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12440)  39.73 
 
 
435 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 
626 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.98 
 
 
729 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 
614 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 
614 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
614 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.22 
 
 
2240 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 
626 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
614 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
614 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
267 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 
279 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
612 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
566 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  37.14 
 
 
388 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  38.24 
 
 
291 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
654 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
563 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.15 
 
 
314 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
212 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 
233 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 
927 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  35.38 
 
 
379 aa  47.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  36.23 
 
 
386 aa  47  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 
1067 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  39.39 
 
 
377 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  44.12 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  40.85 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  37.68 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0039  chaperone protein DnaJ  35.38 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553213  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
4079 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  34.29 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  36.23 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
605 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
602 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.26 
 
 
458 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  42.42 
 
 
335 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  35.94 
 
 
373 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 
391 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  36.23 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.78 
 
 
286 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  43.94 
 
 
310 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  43.94 
 
 
310 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  36.23 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  41.43 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  35.38 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  35.38 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  37.68 
 
 
246 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  40.91 
 
 
375 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
762 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 
917 aa  45.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
376 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.85 
 
 
334 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3191  chaperone protein DnaJ  40.91 
 
 
375 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
376 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03160  chaperone regulator, putative  33.33 
 
 
498 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 
1979 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  40.91 
 
 
313 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  45.59 
 
 
406 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25.41 
 
 
252 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.77 
 
 
1694 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
306 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  39.39 
 
 
303 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1286  chaperone DnaJ  27.27 
 
 
373 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.31 
 
 
784 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  31.94 
 
 
307 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  43.06 
 
 
325 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.44 
 
 
324 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
379 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
284 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  35.94 
 
 
379 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  33.85 
 
 
384 aa  43.9  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
395 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.08 
 
 
331 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
379 aa  43.9  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  36.92 
 
 
379 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 
279 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
369 aa  43.5  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>