More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2426 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  100 
 
 		 549 aa  1127    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  75.41 
 
 		 545 aa  853    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  91.19 
 
 		 546 aa  1022    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  39.89 
 
 		 557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 539 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  35.4 
 
 		 538 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  32.13 
 
 		 543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  34.81 
 
 		 541 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  35.28 
 
 		 564 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  36.43 
 
 		 548 aa  266  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  36.01 
 
 		 539 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  35.35 
 
 		 537 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.88 
 
 		 548 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  33.09 
 
 		 543 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.6 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  32.01 
 
 		 564 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.95 
 
 		 542 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  30.8 
 
 		 539 aa  243  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.84 
 
 		 556 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.16 
 
 		 549 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 541 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  30.04 
 
 		 522 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  32.64 
 
 		 583 aa  229  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 631 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  31.64 
 
 		 622 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  29.86 
 
 		 522 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.93 
 
 		 530 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  29.04 
 
 		 522 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  30.9 
 
 		 660 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.5 
 
 		 522 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 619 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.86 
 
 		 522 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  29.22 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  29.22 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 660 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.24 
 
 		 522 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  29.76 
 
 		 660 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  30.93 
 
 		 655 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  29.91 
 
 		 621 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.18 
 
 		 522 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  29.98 
 
 		 660 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.18 
 
 		 543 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 520 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.41 
 
 		 556 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.89 
 
 		 553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  30.8 
 
 		 630 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 658 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 630 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  30.8 
 
 		 630 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 630 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  29.89 
 
 		 612 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 522 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 660 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  29.17 
 
 		 611 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 625 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.96 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  28.31 
 
 		 527 aa  210  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  29.22 
 
 		 656 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  28.81 
 
 		 613 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  29.89 
 
 		 629 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  33.58 
 
 		 522 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.05 
 
 		 537 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  31.74 
 
 		 556 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  31.81 
 
 		 525 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  30.28 
 
 		 612 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 629 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  28.81 
 
 		 611 aa  207  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 629 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  28.81 
 
 		 611 aa  206  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 535 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  28.96 
 
 		 660 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.51 
 
 		 569 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  28.99 
 
 		 612 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 630 aa  206  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  31.06 
 
 		 564 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  29.89 
 
 		 629 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.06 
 
 		 560 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  29.17 
 
 		 659 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 593 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 527 aa  204  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  28.62 
 
 		 611 aa  203  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 629 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  29.72 
 
 		 629 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.31 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  29.72 
 
 		 629 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  29.35 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  29.1 
 
 		 626 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.6 
 
 		 540 aa  201  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  29.41 
 
 		 626 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 626 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  30.92 
 
 		 520 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.96 
 
 		 569 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 632 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 591 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  30.55 
 
 		 602 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.37 
 
 		 584 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  31.78 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 533 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>