40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2417 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  670    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  93.33 
 
 		 345 aa  631  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  38.01 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  30.85 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3828  hypothetical protein  28.27 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  27.5 
 
 		 1195 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  25.85 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  30.97 
 
 		 859 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  31.62 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  30.97 
 
 		 916 aa  56.2  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 783 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  35.04 
 
 		 853 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  21.56 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  31.93 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  28.92 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  41.82 
 
 		 811 aa  50.1  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2970  hypothetical protein  27.14 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.145955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  29.91 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  26.21 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  27.53 
 
 		 773 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  32.14 
 
 		 873 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  33.94 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  29.2 
 
 		 843 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  33.73 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  19.28 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  32.43 
 
 		 793 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  30.93 
 
 		 801 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  28.79 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  27.34 
 
 		 353 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1099  hypothetical protein  20.82 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  47.17 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0731  hypothetical protein  22.78 
 
 		 573 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  41.82 
 
 		 872 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  25.56 
 
 		 378 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  29.73 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  25.56 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  25.56 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  25.2 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>