More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2405 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 313 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  92.01 
 
 		 313 aa  588  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  82.32 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  54.19 
 
 		 338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  53.07 
 
 		 312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.09 
 
 		 306 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  54.72 
 
 		 323 aa  328  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  50.96 
 
 		 307 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  51.61 
 
 		 301 aa  315  8e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  51.6 
 
 		 315 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  56.72 
 
 		 312 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 309 aa  311  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 316 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  52.58 
 
 		 312 aa  308  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 316 aa  308  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  51.61 
 
 		 318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 		 316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 		 316 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 		 316 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 		 316 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  51.94 
 
 		 312 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 309 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 		 316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  50.8 
 
 		 317 aa  301  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  48.23 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  53.23 
 
 		 317 aa  298  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  47.42 
 
 		 316 aa  298  7e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 		 311 aa  298  9e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 340 aa  298  9e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0331  ornithine carbamoyltransferase  48.22 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  48.55 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  51.29 
 
 		 304 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 311 aa  295  9e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  48.55 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  48.55 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  52.09 
 
 		 355 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  48.55 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  51.91 
 
 		 311 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  51.91 
 
 		 311 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 		 306 aa  292  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 		 305 aa  291  7e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 312 aa  291  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 		 301 aa  291  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  46.3 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.06 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  47.27 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  48.22 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 		 323 aa  289  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  47.74 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 309 aa  288  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 		 319 aa  288  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  47.59 
 
 		 312 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  49.2 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  47.74 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.66 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  47.13 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  47.59 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  45.31 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  49.52 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  47.76 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 301 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  47.57 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  45.98 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  45.31 
 
 		 318 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  47.42 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  48.88 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  48.55 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  47.59 
 
 		 301 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  45.19 
 
 		 305 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  48.71 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  41.1 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>