140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2404 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  62.43 
 
 
204 aa  243  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  60.32 
 
 
204 aa  236  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  61.05 
 
 
205 aa  230  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  60.89 
 
 
205 aa  226  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  59.47 
 
 
205 aa  224  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  61.26 
 
 
205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  61.24 
 
 
233 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  55.22 
 
 
205 aa  207  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3074  hypothetical protein  60.78 
 
 
188 aa  174  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  43.55 
 
 
203 aa  124  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  32.8 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  28.5 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.46 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  31.11 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  27.43 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  30.39 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  31.14 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  32.22 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  28.89 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  28.95 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  25.93 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0819  protein of unknown function DUF820  32.99 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0957178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  24.73 
 
 
187 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  30.17 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  26.49 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  30.81 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  26.19 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  29.21 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  25.38 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  24.04 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  28.76 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  28.65 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  25.3 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0820  protein of unknown function DUF820  33.91 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0980811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  31.32 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  33.55 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  27.86 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  28.82 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  25.14 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  25.97 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  34.43 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  28.96 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  29.47 
 
 
237 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  27.04 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  26.6 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  27.54 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  22.53 
 
 
181 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  29.56 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  27.91 
 
 
184 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  34.78 
 
 
202 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  30.43 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  33.87 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  32.86 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  31.07 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  30.51 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  27.95 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  23.68 
 
 
195 aa  58.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  27.87 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  26.03 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  26.22 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  26.14 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  31.82 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  26.84 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  25.4 
 
 
182 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  32.02 
 
 
185 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  29.3 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  22.89 
 
 
198 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2126  hypothetical protein  25.59 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  25.41 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  27.46 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  26.97 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1377  protein of unknown function DUF820  26.37 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  25.83 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  31.71 
 
 
193 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4202  hypothetical protein  29.03 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  28.65 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  26.14 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  25.14 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  29.79 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  27.41 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  29.88 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  25.61 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  25.99 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  30.22 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  32.14 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  31.71 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  25.7 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>