22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2358 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  84.66 
 
 
792 aa  1266    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  100 
 
 
769 aa  1550    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  48.08 
 
 
758 aa  624  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  48.97 
 
 
760 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  45.81 
 
 
773 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2975  peptidase domain protein  50 
 
 
484 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  49.66 
 
 
891 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  48.29 
 
 
576 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  51.11 
 
 
709 aa  243  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  45.26 
 
 
629 aa  235  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  48.72 
 
 
710 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  47.37 
 
 
618 aa  232  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  44.11 
 
 
717 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  43.64 
 
 
620 aa  213  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  42.8 
 
 
289 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  41.95 
 
 
289 aa  197  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  41.97 
 
 
510 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
689 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  27.82 
 
 
400 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  30.83 
 
 
281 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  33.01 
 
 
5899 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.69 
 
 
688 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>