More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2349 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  88.28 
 
 
367 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2349  cell cycle protein  100 
 
 
367 aa  729    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  48.4 
 
 
374 aa  349  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4040  cell cycle protein  46.38 
 
 
380 aa  309  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  44.23 
 
 
373 aa  276  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  38.06 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  39.4 
 
 
365 aa  248  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.45 
 
 
379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 
371 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  38.2 
 
 
388 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  39.05 
 
 
412 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.81 
 
 
366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.94 
 
 
378 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.76 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 
366 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  37.13 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  39.35 
 
 
387 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  36.8 
 
 
368 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 
378 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 
363 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.71 
 
 
366 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  37.08 
 
 
367 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  37.08 
 
 
367 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  37.92 
 
 
367 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37.78 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  37.95 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 
366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  37.53 
 
 
367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  37.33 
 
 
370 aa  212  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 
368 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  38.56 
 
 
411 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 
372 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1526  cell cycle protein  44.08 
 
 
379 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  37.5 
 
 
370 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  37.5 
 
 
370 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  37.5 
 
 
370 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 
374 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 
366 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 
368 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 
368 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 
368 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 
368 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 
388 aa  206  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  36.64 
 
 
366 aa  205  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  36.42 
 
 
368 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.07 
 
 
376 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  36.03 
 
 
372 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  36.1 
 
 
373 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  38.67 
 
 
411 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  38.51 
 
 
398 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  37.12 
 
 
365 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  39.6 
 
 
387 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  38.67 
 
 
413 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 
385 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  36.68 
 
 
371 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 
373 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  36.92 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.52 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  36.03 
 
 
372 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  38.4 
 
 
401 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.23 
 
 
368 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  36.18 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  35.45 
 
 
368 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  37.74 
 
 
382 aa  195  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  37.47 
 
 
367 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  38.06 
 
 
369 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 
368 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  35.09 
 
 
383 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  35.26 
 
 
370 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 
404 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  39.2 
 
 
380 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 
368 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  38.69 
 
 
361 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  36.6 
 
 
370 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  37.82 
 
 
381 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.6 
 
 
368 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.87 
 
 
368 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  37.89 
 
 
382 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  36.31 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  38.04 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  36.31 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  34.62 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 
373 aa  190  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  34.95 
 
 
391 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 
372 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  38.06 
 
 
373 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  34.37 
 
 
373 aa  189  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  38.1 
 
 
365 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>