More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2263 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  92.35 
 
 		 370 aa  681    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 367 aa  749    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  41.53 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  36.68 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  37.95 
 
 		 311 aa  226  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  43.51 
 
 		 330 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  37.57 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  35.59 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  35.59 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  42.42 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  34.15 
 
 		 349 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  34.43 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  37.14 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  36.59 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  35 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  37.54 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.49 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  35.75 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  38.41 
 
 		 371 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  40.16 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  35.4 
 
 		 352 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  36.83 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  37.86 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  36.51 
 
 		 354 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  33.05 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  39.1 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  35.69 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  39.1 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  38.34 
 
 		 434 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  38.14 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  36.51 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  37.79 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  36.57 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  39.62 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  36.48 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  35.67 
 
 		 372 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  35.17 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  38.78 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  35.37 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  39.85 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  35.24 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  33.44 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  34.47 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  32.91 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  29.5 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.89 
 
 		 279 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  34.93 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  35.89 
 
 		 279 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 279 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  29.35 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  34.85 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  28.61 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  28.61 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  35.91 
 
 		 290 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  33.21 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  32.45 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  30.33 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  30.21 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29.68 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  31.29 
 
 		 524 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.58 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  30.16 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 		 513 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 		 513 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  30.19 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  32.86 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  37.07 
 
 		 232 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  29.3 
 
 		 528 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  30.21 
 
 		 518 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  30.77 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  30.21 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  25.44 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  31.8 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  34.8 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>