150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2260 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  78.74 
 
 		 207 aa  325  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  55.21 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  53.65 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  52.08 
 
 		 203 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  51.56 
 
 		 203 aa  184  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  51.04 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  55.64 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  41.62 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  43.39 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  38 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  39.2 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  40.22 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  40.76 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  31.82 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  37.69 
 
 		 183 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  33.52 
 
 		 182 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  34.62 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  37.02 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  38.58 
 
 		 180 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  38 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  34.93 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  41.03 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  34.62 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  30.56 
 
 		 257 aa  85.5  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  32.78 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  28.65 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  34.62 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  38.22 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  34.32 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  30.9 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  25.54 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  28.99 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  27.98 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  28.43 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  29.27 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  29.95 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  31.09 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.98 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  25.26 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  30.39 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  28.42 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  28.34 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  31.74 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.03 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  27.96 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  23.66 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  28.4 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  28.34 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  28.49 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  28 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  29.94 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  29.09 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  25.44 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  28.09 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  24.88 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  28.36 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  22.7 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  28.89 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  28.4 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  25.68 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  30.09 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  26.26 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  27.33 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  28.33 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  29.09 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  23.78 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  26.14 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  30.95 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  27.91 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  27.11 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3748  protein of unknown function DUF820  29.32 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956591  normal  0.471613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1466  hypothetical protein  31.37 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0533838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  26.26 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  26.49 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  31.37 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  30.54 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0100  hypothetical protein  34.65 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637727  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  30.36 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  30.95 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  30.12 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  25.14 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  26.97 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>