83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2240 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1253    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  84.79 
 
 		 619 aa  1053    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  51.03 
 
 		 537 aa  435  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  46.24 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  45.13 
 
 		 595 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  46.42 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  46.77 
 
 		 532 aa  409  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  46.84 
 
 		 527 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  46.37 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.61 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  48.02 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  46.05 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  45.96 
 
 		 530 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  47.23 
 
 		 531 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  40.54 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  30.32 
 
 		 660 aa  186  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 676 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  28.18 
 
 		 675 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  26.98 
 
 		 692 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  26.57 
 
 		 679 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  26.57 
 
 		 679 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  28.3 
 
 		 669 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 661 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  28.53 
 
 		 696 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  28.25 
 
 		 696 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  28.44 
 
 		 691 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  30.12 
 
 		 582 aa  147  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  29.06 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  29.85 
 
 		 595 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  29.43 
 
 		 584 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  29.45 
 
 		 584 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  28.7 
 
 		 595 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  27.51 
 
 		 595 aa  104  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  28.75 
 
 		 585 aa  95.1  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  27.55 
 
 		 601 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.01 
 
 		 758 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  24.71 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  24.13 
 
 		 764 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  23.57 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  21.68 
 
 		 706 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  25.23 
 
 		 757 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  23.92 
 
 		 668 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  23.41 
 
 		 680 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  23.9 
 
 		 764 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  24.67 
 
 		 797 aa  70.5  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  33.12 
 
 		 748 aa  67.8  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  24.08 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  24.04 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  29.83 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  29.88 
 
 		 672 aa  64.3  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  24.19 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  23.12 
 
 		 595 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  24.08 
 
 		 454 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30.41 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.97 
 
 		 435 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  32.41 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 464 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.48 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  23.23 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.29 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  21.88 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  25 
 
 		 432 aa  57  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.87 
 
 		 722 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.68 
 
 		 445 aa  54.7  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  28.67 
 
 		 763 aa  53.9  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  30.23 
 
 		 761 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  21.85 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  22.11 
 
 		 459 aa  52.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 453 aa  50.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.67 
 
 		 457 aa  50.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 478 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 457 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  21.26 
 
 		 445 aa  48.5  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  20.64 
 
 		 456 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.86 
 
 		 600 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  22.29 
 
 		 448 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  26.61 
 
 		 431 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  31.3 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  29.46 
 
 		 784 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 421 aa  44.3  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  26.76 
 
 		 618 aa  44.3  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>