106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2223 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  83.78 
 
 		 259 aa  322  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  71.78 
 
 		 244 aa  322  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  70.08 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  82.7 
 
 		 245 aa  319  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  82.7 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  82.16 
 
 		 245 aa  318  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  76.5 
 
 		 200 aa  317  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  78.38 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  67.78 
 
 		 230 aa  308  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  63.18 
 
 		 217 aa  291  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  62.24 
 
 		 222 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  76.11 
 
 		 259 aa  285  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  56.79 
 
 		 230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  54.31 
 
 		 229 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  51.81 
 
 		 260 aa  261  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  49.79 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  50.83 
 
 		 229 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  52.63 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  52.65 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  52.32 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  52.16 
 
 		 248 aa  244  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  52.16 
 
 		 248 aa  244  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  46.5 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  46.5 
 
 		 217 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  48.98 
 
 		 218 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  50 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  48.73 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  48.73 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  47.34 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  59.76 
 
 		 114 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  36.36 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  34.77 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  34.02 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  31.4 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  30.7 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  31.67 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  26.98 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  27.38 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  40.46 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  27.2 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  27.2 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  27.68 
 
 		 284 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  34.71 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  34.12 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  34.1 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  30.04 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  39.2 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  27.8 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  35.07 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  27.73 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  28.7 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  27.45 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  25.48 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  24.36 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  25.79 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  25.29 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  39.05 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  30.97 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  29.25 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  36.5 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  27.93 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  29.25 
 
 		 332 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  29.25 
 
 		 330 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  28.81 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  31.72 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  37.5 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  27.38 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  26.94 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  40.91 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  32.2 
 
 		 340 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  26.32 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  29.91 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  33.84 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  35.82 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  51.28 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  24.79 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  32.73 
 
 		 187 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  40.62 
 
 		 189 aa  45.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  30.49 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  32.31 
 
 		 190 aa  45.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  30.26 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  48.84 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  27.63 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  30.49 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  32.93 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  35.94 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  48.72 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  30.68 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  30.38 
 
 		 193 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>